Protein–RNA interactions for Protein: P29374

ARID4A, AT-rich interactive domain-containing protein 4A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,257 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID4AP29374 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ARID4AP29374 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ARID4AP29374 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
ARID4AP29374 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ARID4AP29374 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ARID4AP29374 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ARID4AP29374 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ARID4AP29374 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ARID4AP29374 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
ARID4AP29374 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
ARID4AP29374 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ARID4AP29374 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
ARID4AP29374 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ARID4AP29374 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ARID4AP29374 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ARID4AP29374 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ARID4AP29374 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ARID4AP29374 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ARID4AP29374 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ARID4AP29374 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ARID4AP29374 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ARID4AP29374 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ARID4AP29374 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ARID4AP29374 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ARID4AP29374 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ARID4AP29374 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ARID4AP29374 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ARID4AP29374 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ARID4AP29374 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ARID4AP29374 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ARID4AP29374 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ARID4AP29374 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ARID4AP29374 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ARID4AP29374 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ARID4AP29374 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ARID4AP29374 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ARID4AP29374 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ARID4AP29374 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
ARID4AP29374 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ARID4AP29374 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
ARID4AP29374 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ARID4AP29374 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
ARID4AP29374 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ARID4AP29374 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ARID4AP29374 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ARID4AP29374 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ARID4AP29374 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
ARID4AP29374 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ARID4AP29374 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ARID4AP29374 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ARID4AP29374 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ARID4AP29374 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ARID4AP29374 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ARID4AP29374 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ARID4AP29374 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ARID4AP29374 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ARID4AP29374 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ARID4AP29374 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ARID4AP29374 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
ARID4AP29374 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ARID4AP29374 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ARID4AP29374 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ARID4AP29374 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
ARID4AP29374 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ARID4AP29374 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ARID4AP29374 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
ARID4AP29374 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ARID4AP29374 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ARID4AP29374 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ARID4AP29374 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ARID4AP29374 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ARID4AP29374 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ARID4AP29374 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ARID4AP29374 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ARID4AP29374 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ARID4AP29374 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ARID4AP29374 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ARID4AP29374 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ARID4AP29374 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ARID4AP29374 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ARID4AP29374 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ARID4AP29374 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ARID4AP29374 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ARID4AP29374 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ARID4AP29374 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ARID4AP29374 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ARID4AP29374 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ARID4AP29374 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ARID4AP29374 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ARID4AP29374 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ARID4AP29374 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ARID4AP29374 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ARID4AP29374 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ARID4AP29374 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ARID4AP29374 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
ARID4AP29374 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ARID4AP29374 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ARID4AP29374 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ARID4AP29374 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ARID4AP29374 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
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