Protein–RNA interactions for Protein: P21579

SYT1, Synaptotagmin-1, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT1P21579 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYT1P21579 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYT1P21579 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYT1P21579 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYT1P21579 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYT1P21579 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SYT1P21579 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYT1P21579 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYT1P21579 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYT1P21579 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYT1P21579 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYT1P21579 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYT1P21579 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYT1P21579 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYT1P21579 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYT1P21579 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYT1P21579 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYT1P21579 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SYT1P21579 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYT1P21579 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYT1P21579 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYT1P21579 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYT1P21579 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYT1P21579 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYT1P21579 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYT1P21579 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYT1P21579 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYT1P21579 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYT1P21579 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYT1P21579 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYT1P21579 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYT1P21579 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYT1P21579 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SYT1P21579 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYT1P21579 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYT1P21579 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYT1P21579 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYT1P21579 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYT1P21579 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYT1P21579 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYT1P21579 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYT1P21579 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYT1P21579 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYT1P21579 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYT1P21579 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SYT1P21579 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SYT1P21579 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SYT1P21579 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SYT1P21579 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SYT1P21579 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SYT1P21579 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SYT1P21579 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SYT1P21579 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SYT1P21579 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SYT1P21579 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SYT1P21579 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SYT1P21579 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SYT1P21579 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SYT1P21579 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SYT1P21579 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SYT1P21579 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SYT1P21579 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SYT1P21579 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SYT1P21579 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SYT1P21579 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SYT1P21579 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SYT1P21579 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SYT1P21579 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SYT1P21579 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SYT1P21579 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
SYT1P21579 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SYT1P21579 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SYT1P21579 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
SYT1P21579 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYT1P21579 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYT1P21579 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYT1P21579 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYT1P21579 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYT1P21579 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYT1P21579 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYT1P21579 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYT1P21579 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYT1P21579 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYT1P21579 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYT1P21579 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYT1P21579 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYT1P21579 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYT1P21579 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYT1P21579 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYT1P21579 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYT1P21579 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYT1P21579 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYT1P21579 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYT1P21579 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYT1P21579 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYT1P21579 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYT1P21579 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYT1P21579 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYT1P21579 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYT1P21579 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms