Protein–RNA interactions for Protein: P14867

GABRA1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA1P14867 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GABRA1P14867 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GABRA1P14867 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GABRA1P14867 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GABRA1P14867 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GABRA1P14867 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GABRA1P14867 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GABRA1P14867 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GABRA1P14867 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GABRA1P14867 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABRA1P14867 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABRA1P14867 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABRA1P14867 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABRA1P14867 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABRA1P14867 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABRA1P14867 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABRA1P14867 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABRA1P14867 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABRA1P14867 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABRA1P14867 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABRA1P14867 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABRA1P14867 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABRA1P14867 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GABRA1P14867 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABRA1P14867 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GABRA1P14867 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GABRA1P14867 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABRA1P14867 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GABRA1P14867 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GABRA1P14867 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABRA1P14867 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABRA1P14867 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABRA1P14867 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABRA1P14867 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABRA1P14867 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABRA1P14867 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GABRA1P14867 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABRA1P14867 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABRA1P14867 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GABRA1P14867 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABRA1P14867 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABRA1P14867 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABRA1P14867 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABRA1P14867 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABRA1P14867 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABRA1P14867 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABRA1P14867 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABRA1P14867 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABRA1P14867 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABRA1P14867 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABRA1P14867 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABRA1P14867 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GABRA1P14867 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABRA1P14867 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABRA1P14867 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABRA1P14867 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABRA1P14867 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABRA1P14867 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABRA1P14867 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABRA1P14867 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABRA1P14867 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABRA1P14867 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABRA1P14867 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABRA1P14867 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GABRA1P14867 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABRA1P14867 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABRA1P14867 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABRA1P14867 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABRA1P14867 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABRA1P14867 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABRA1P14867 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABRA1P14867 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABRA1P14867 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABRA1P14867 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABRA1P14867 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABRA1P14867 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABRA1P14867 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABRA1P14867 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GABRA1P14867 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABRA1P14867 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABRA1P14867 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABRA1P14867 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABRA1P14867 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABRA1P14867 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GABRA1P14867 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABRA1P14867 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GABRA1P14867 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABRA1P14867 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABRA1P14867 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GABRA1P14867 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABRA1P14867 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABRA1P14867 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABRA1P14867 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABRA1P14867 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABRA1P14867 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABRA1P14867 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABRA1P14867 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABRA1P14867 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABRA1P14867 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABRA1P14867 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms