Protein–RNA interactions for Protein: P11926

ODC1, Ornithine decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1P11926 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ODC1P11926 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ODC1P11926 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ODC1P11926 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ODC1P11926 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ODC1P11926 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ODC1P11926 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ODC1P11926 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ODC1P11926 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
ODC1P11926 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ODC1P11926 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ODC1P11926 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ODC1P11926 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ODC1P11926 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ODC1P11926 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
ODC1P11926 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ODC1P11926 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ODC1P11926 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ODC1P11926 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ODC1P11926 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ODC1P11926 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
ODC1P11926 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ODC1P11926 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ODC1P11926 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ODC1P11926 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ODC1P11926 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ODC1P11926 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ODC1P11926 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ODC1P11926 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ODC1P11926 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ODC1P11926 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ODC1P11926 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ODC1P11926 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ODC1P11926 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ODC1P11926 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
ODC1P11926 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ODC1P11926 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ODC1P11926 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ODC1P11926 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ODC1P11926 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ODC1P11926 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ODC1P11926 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ODC1P11926 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ODC1P11926 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ODC1P11926 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ODC1P11926 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ODC1P11926 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ODC1P11926 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
ODC1P11926 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ODC1P11926 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ODC1P11926 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ODC1P11926 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ODC1P11926 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ODC1P11926 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
ODC1P11926 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ODC1P11926 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
ODC1P11926 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ODC1P11926 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ODC1P11926 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ODC1P11926 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ODC1P11926 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ODC1P11926 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ODC1P11926 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ODC1P11926 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ODC1P11926 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ODC1P11926 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ODC1P11926 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ODC1P11926 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ODC1P11926 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ODC1P11926 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ODC1P11926 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ODC1P11926 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ODC1P11926 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ODC1P11926 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ODC1P11926 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ODC1P11926 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ODC1P11926 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ODC1P11926 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ODC1P11926 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ODC1P11926 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ODC1P11926 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ODC1P11926 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ODC1P11926 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ODC1P11926 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ODC1P11926 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ODC1P11926 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ODC1P11926 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ODC1P11926 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ODC1P11926 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ODC1P11926 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ODC1P11926 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ODC1P11926 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ODC1P11926 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ODC1P11926 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ODC1P11926 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ODC1P11926 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ODC1P11926 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ODC1P11926 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ODC1P11926 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ODC1P11926 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms