Protein–RNA interactions for Protein: P10092

CALCB, Calcitonin gene-related peptide 2, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCBP10092 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CALCBP10092 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CALCBP10092 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CALCBP10092 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CALCBP10092 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CALCBP10092 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CALCBP10092 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CALCBP10092 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CALCBP10092 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CALCBP10092 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CALCBP10092 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CALCBP10092 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CALCBP10092 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CALCBP10092 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CALCBP10092 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CALCBP10092 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CALCBP10092 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CALCBP10092 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CALCBP10092 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CALCBP10092 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CALCBP10092 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CALCBP10092 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CALCBP10092 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CALCBP10092 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CALCBP10092 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CALCBP10092 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CALCBP10092 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CALCBP10092 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CALCBP10092 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CALCBP10092 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CALCBP10092 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CALCBP10092 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CALCBP10092 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CALCBP10092 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CALCBP10092 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CALCBP10092 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CALCBP10092 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CALCBP10092 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CALCBP10092 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CALCBP10092 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CALCBP10092 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CALCBP10092 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CALCBP10092 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CALCBP10092 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CALCBP10092 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CALCBP10092 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CALCBP10092 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CALCBP10092 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CALCBP10092 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CALCBP10092 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CALCBP10092 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CALCBP10092 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CALCBP10092 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CALCBP10092 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CALCBP10092 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CALCBP10092 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CALCBP10092 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CALCBP10092 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CALCBP10092 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CALCBP10092 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CALCBP10092 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CALCBP10092 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CALCBP10092 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CALCBP10092 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CALCBP10092 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CALCBP10092 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CALCBP10092 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CALCBP10092 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CALCBP10092 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CALCBP10092 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CALCBP10092 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CALCBP10092 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CALCBP10092 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CALCBP10092 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CALCBP10092 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CALCBP10092 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CALCBP10092 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CALCBP10092 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CALCBP10092 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CALCBP10092 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CALCBP10092 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CALCBP10092 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CALCBP10092 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CALCBP10092 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CALCBP10092 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CALCBP10092 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CALCBP10092 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CALCBP10092 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CALCBP10092 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CALCBP10092 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CALCBP10092 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CALCBP10092 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CALCBP10092 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CALCBP10092 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CALCBP10092 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CALCBP10092 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CALCBP10092 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CALCBP10092 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CALCBP10092 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CALCBP10092 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms