Protein–RNA interactions for Protein: P0C843

LINC00032, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00032, humanhuman

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00032P0C843 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LINC00032P0C843 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LINC00032P0C843 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LINC00032P0C843 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LINC00032P0C843 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LINC00032P0C843 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LINC00032P0C843 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LINC00032P0C843 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC00032P0C843 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC00032P0C843 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC00032P0C843 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC00032P0C843 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC00032P0C843 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC00032P0C843 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC00032P0C843 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC00032P0C843 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC00032P0C843 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC00032P0C843 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC00032P0C843 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC00032P0C843 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC00032P0C843 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC00032P0C843 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC00032P0C843 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC00032P0C843 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC00032P0C843 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC00032P0C843 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC00032P0C843 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC00032P0C843 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC00032P0C843 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC00032P0C843 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC00032P0C843 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC00032P0C843 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC00032P0C843 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC00032P0C843 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC00032P0C843 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC00032P0C843 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC00032P0C843 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC00032P0C843 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC00032P0C843 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC00032P0C843 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC00032P0C843 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC00032P0C843 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC00032P0C843 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC00032P0C843 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC00032P0C843 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC00032P0C843 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC00032P0C843 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC00032P0C843 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC00032P0C843 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC00032P0C843 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC00032P0C843 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC00032P0C843 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC00032P0C843 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC00032P0C843 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC00032P0C843 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC00032P0C843 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC00032P0C843 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC00032P0C843 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC00032P0C843 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC00032P0C843 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC00032P0C843 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC00032P0C843 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC00032P0C843 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC00032P0C843 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC00032P0C843 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC00032P0C843 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC00032P0C843 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC00032P0C843 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC00032P0C843 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC00032P0C843 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC00032P0C843 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC00032P0C843 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC00032P0C843 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC00032P0C843 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC00032P0C843 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC00032P0C843 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LINC00032P0C843 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LINC00032P0C843 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LINC00032P0C843 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LINC00032P0C843 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LINC00032P0C843 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LINC00032P0C843 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LINC00032P0C843 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LINC00032P0C843 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LINC00032P0C843 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LINC00032P0C843 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LINC00032P0C843 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LINC00032P0C843 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LINC00032P0C843 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LINC00032P0C843 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LINC00032P0C843 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LINC00032P0C843 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LINC00032P0C843 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LINC00032P0C843 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LINC00032P0C843 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LINC00032P0C843 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LINC00032P0C843 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LINC00032P0C843 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LINC00032P0C843 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
LINC00032P0C843 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms