Protein–RNA interactions for Protein: P08138

NGFR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 16, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NGFRP08138 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NGFRP08138 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NGFRP08138 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NGFRP08138 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NGFRP08138 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
NGFRP08138 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
NGFRP08138 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NGFRP08138 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NGFRP08138 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NGFRP08138 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NGFRP08138 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NGFRP08138 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NGFRP08138 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NGFRP08138 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NGFRP08138 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NGFRP08138 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NGFRP08138 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
NGFRP08138 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NGFRP08138 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NGFRP08138 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NGFRP08138 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NGFRP08138 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NGFRP08138 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NGFRP08138 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NGFRP08138 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NGFRP08138 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NGFRP08138 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NGFRP08138 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NGFRP08138 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NGFRP08138 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NGFRP08138 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
NGFRP08138 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NGFRP08138 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NGFRP08138 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NGFRP08138 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NGFRP08138 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NGFRP08138 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NGFRP08138 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NGFRP08138 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NGFRP08138 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NGFRP08138 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NGFRP08138 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NGFRP08138 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NGFRP08138 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
NGFRP08138 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NGFRP08138 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NGFRP08138 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
NGFRP08138 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NGFRP08138 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NGFRP08138 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
NGFRP08138 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NGFRP08138 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NGFRP08138 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NGFRP08138 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NGFRP08138 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
NGFRP08138 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NGFRP08138 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NGFRP08138 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NGFRP08138 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NGFRP08138 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NGFRP08138 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NGFRP08138 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NGFRP08138 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NGFRP08138 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NGFRP08138 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NGFRP08138 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NGFRP08138 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NGFRP08138 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NGFRP08138 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NGFRP08138 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NGFRP08138 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NGFRP08138 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NGFRP08138 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
NGFRP08138 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NGFRP08138 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NGFRP08138 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NGFRP08138 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NGFRP08138 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NGFRP08138 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NGFRP08138 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
NGFRP08138 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
NGFRP08138 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NGFRP08138 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NGFRP08138 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
NGFRP08138 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NGFRP08138 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NGFRP08138 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NGFRP08138 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NGFRP08138 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NGFRP08138 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NGFRP08138 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NGFRP08138 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NGFRP08138 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NGFRP08138 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NGFRP08138 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NGFRP08138 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NGFRP08138 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NGFRP08138 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NGFRP08138 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NGFRP08138 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms