Protein–RNA interactions for Protein: P02654

APOC1, Apolipoprotein C-I, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC1P02654 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOC1P02654 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOC1P02654 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOC1P02654 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOC1P02654 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOC1P02654 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOC1P02654 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOC1P02654 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOC1P02654 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOC1P02654 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOC1P02654 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOC1P02654 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOC1P02654 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOC1P02654 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOC1P02654 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOC1P02654 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOC1P02654 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOC1P02654 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOC1P02654 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOC1P02654 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOC1P02654 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOC1P02654 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOC1P02654 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOC1P02654 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOC1P02654 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOC1P02654 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
APOC1P02654 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
APOC1P02654 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOC1P02654 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
APOC1P02654 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
APOC1P02654 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOC1P02654 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOC1P02654 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOC1P02654 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOC1P02654 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOC1P02654 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOC1P02654 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOC1P02654 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOC1P02654 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOC1P02654 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOC1P02654 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOC1P02654 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOC1P02654 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOC1P02654 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOC1P02654 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOC1P02654 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOC1P02654 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
APOC1P02654 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
APOC1P02654 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
APOC1P02654 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
APOC1P02654 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
APOC1P02654 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
APOC1P02654 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
APOC1P02654 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
APOC1P02654 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
APOC1P02654 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
APOC1P02654 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
APOC1P02654 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
APOC1P02654 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
APOC1P02654 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
APOC1P02654 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
APOC1P02654 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
APOC1P02654 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOC1P02654 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOC1P02654 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOC1P02654 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOC1P02654 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOC1P02654 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOC1P02654 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOC1P02654 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOC1P02654 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOC1P02654 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOC1P02654 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOC1P02654 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOC1P02654 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOC1P02654 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOC1P02654 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOC1P02654 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
APOC1P02654 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
APOC1P02654 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
APOC1P02654 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
APOC1P02654 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOC1P02654 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
APOC1P02654 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOC1P02654 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
APOC1P02654 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOC1P02654 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOC1P02654 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOC1P02654 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
APOC1P02654 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOC1P02654 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOC1P02654 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
APOC1P02654 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOC1P02654 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOC1P02654 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOC1P02654 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOC1P02654 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOC1P02654 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOC1P02654 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOC1P02654 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms