Protein–RNA interactions for Protein: O75581

LRP6, Low-density lipoprotein receptor-related protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP6O75581 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRP6O75581 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRP6O75581 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRP6O75581 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRP6O75581 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRP6O75581 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRP6O75581 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRP6O75581 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRP6O75581 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRP6O75581 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRP6O75581 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRP6O75581 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
LRP6O75581 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRP6O75581 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRP6O75581 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRP6O75581 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRP6O75581 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRP6O75581 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRP6O75581 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRP6O75581 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
LRP6O75581 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRP6O75581 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRP6O75581 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRP6O75581 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRP6O75581 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRP6O75581 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRP6O75581 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRP6O75581 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRP6O75581 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRP6O75581 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
LRP6O75581 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRP6O75581 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRP6O75581 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRP6O75581 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRP6O75581 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRP6O75581 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRP6O75581 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRP6O75581 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRP6O75581 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRP6O75581 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
LRP6O75581 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
LRP6O75581 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
LRP6O75581 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
LRP6O75581 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRP6O75581 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRP6O75581 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRP6O75581 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
LRP6O75581 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRP6O75581 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRP6O75581 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRP6O75581 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRP6O75581 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRP6O75581 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRP6O75581 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRP6O75581 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRP6O75581 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRP6O75581 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRP6O75581 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRP6O75581 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRP6O75581 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRP6O75581 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRP6O75581 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRP6O75581 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRP6O75581 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRP6O75581 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
LRP6O75581 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRP6O75581 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRP6O75581 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRP6O75581 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRP6O75581 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRP6O75581 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRP6O75581 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRP6O75581 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRP6O75581 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRP6O75581 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRP6O75581 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRP6O75581 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRP6O75581 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
LRP6O75581 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRP6O75581 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRP6O75581 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRP6O75581 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRP6O75581 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRP6O75581 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRP6O75581 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRP6O75581 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRP6O75581 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRP6O75581 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRP6O75581 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRP6O75581 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
LRP6O75581 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRP6O75581 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRP6O75581 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRP6O75581 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRP6O75581 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRP6O75581 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRP6O75581 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRP6O75581 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRP6O75581 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRP6O75581 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms