Protein–RNA interactions for Protein: O60911

CTSV, Cathepsin L2, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSVO60911 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTSVO60911 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTSVO60911 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTSVO60911 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTSVO60911 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTSVO60911 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTSVO60911 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTSVO60911 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTSVO60911 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTSVO60911 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTSVO60911 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTSVO60911 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTSVO60911 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTSVO60911 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTSVO60911 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTSVO60911 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTSVO60911 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTSVO60911 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTSVO60911 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTSVO60911 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTSVO60911 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CTSVO60911 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CTSVO60911 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTSVO60911 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTSVO60911 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTSVO60911 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTSVO60911 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTSVO60911 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTSVO60911 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CTSVO60911 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTSVO60911 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTSVO60911 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CTSVO60911 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTSVO60911 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTSVO60911 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTSVO60911 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CTSVO60911 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTSVO60911 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTSVO60911 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTSVO60911 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTSVO60911 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTSVO60911 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTSVO60911 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTSVO60911 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTSVO60911 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTSVO60911 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTSVO60911 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTSVO60911 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTSVO60911 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTSVO60911 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTSVO60911 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTSVO60911 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTSVO60911 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTSVO60911 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTSVO60911 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CTSVO60911 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTSVO60911 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTSVO60911 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTSVO60911 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTSVO60911 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTSVO60911 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTSVO60911 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTSVO60911 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTSVO60911 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTSVO60911 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTSVO60911 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTSVO60911 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTSVO60911 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTSVO60911 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTSVO60911 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTSVO60911 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTSVO60911 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTSVO60911 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CTSVO60911 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTSVO60911 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTSVO60911 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTSVO60911 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTSVO60911 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTSVO60911 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTSVO60911 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTSVO60911 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CTSVO60911 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CTSVO60911 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTSVO60911 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTSVO60911 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTSVO60911 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTSVO60911 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTSVO60911 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTSVO60911 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTSVO60911 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTSVO60911 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTSVO60911 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTSVO60911 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTSVO60911 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTSVO60911 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTSVO60911 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTSVO60911 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTSVO60911 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTSVO60911 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CTSVO60911 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms