Protein–RNA interactions for Protein: O60613

SELENOF, Selenoprotein F, humanhuman

Predictions only

Length 162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SELENOFO60613 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SELENOFO60613 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SELENOFO60613 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SELENOFO60613 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SELENOFO60613 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SELENOFO60613 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SELENOFO60613 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SELENOFO60613 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SELENOFO60613 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SELENOFO60613 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SELENOFO60613 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SELENOFO60613 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SELENOFO60613 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SELENOFO60613 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SELENOFO60613 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SELENOFO60613 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SELENOFO60613 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SELENOFO60613 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SELENOFO60613 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SELENOFO60613 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SELENOFO60613 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SELENOFO60613 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SELENOFO60613 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SELENOFO60613 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SELENOFO60613 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SELENOFO60613 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SELENOFO60613 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SELENOFO60613 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SELENOFO60613 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SELENOFO60613 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SELENOFO60613 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SELENOFO60613 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SELENOFO60613 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SELENOFO60613 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SELENOFO60613 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SELENOFO60613 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SELENOFO60613 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SELENOFO60613 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SELENOFO60613 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SELENOFO60613 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SELENOFO60613 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SELENOFO60613 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SELENOFO60613 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SELENOFO60613 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SELENOFO60613 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SELENOFO60613 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SELENOFO60613 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SELENOFO60613 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SELENOFO60613 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SELENOFO60613 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SELENOFO60613 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SELENOFO60613 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SELENOFO60613 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SELENOFO60613 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SELENOFO60613 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SELENOFO60613 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SELENOFO60613 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SELENOFO60613 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SELENOFO60613 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SELENOFO60613 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SELENOFO60613 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SELENOFO60613 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SELENOFO60613 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SELENOFO60613 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SELENOFO60613 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SELENOFO60613 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SELENOFO60613 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SELENOFO60613 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SELENOFO60613 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SELENOFO60613 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SELENOFO60613 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SELENOFO60613 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SELENOFO60613 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SELENOFO60613 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SELENOFO60613 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SELENOFO60613 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SELENOFO60613 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SELENOFO60613 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SELENOFO60613 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SELENOFO60613 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SELENOFO60613 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SELENOFO60613 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SELENOFO60613 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SELENOFO60613 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SELENOFO60613 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SELENOFO60613 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SELENOFO60613 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SELENOFO60613 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SELENOFO60613 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SELENOFO60613 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SELENOFO60613 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SELENOFO60613 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SELENOFO60613 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SELENOFO60613 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SELENOFO60613 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SELENOFO60613 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SELENOFO60613 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SELENOFO60613 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SELENOFO60613 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SELENOFO60613 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms