Protein–RNA interactions for Protein: O60264

SMARCA5, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A member 5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA5O60264 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMARCA5O60264 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMARCA5O60264 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMARCA5O60264 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMARCA5O60264 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMARCA5O60264 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SMARCA5O60264 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SMARCA5O60264 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SMARCA5O60264 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SMARCA5O60264 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SMARCA5O60264 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SMARCA5O60264 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SMARCA5O60264 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SMARCA5O60264 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SMARCA5O60264 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SMARCA5O60264 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SMARCA5O60264 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SMARCA5O60264 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SMARCA5O60264 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SMARCA5O60264 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SMARCA5O60264 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SMARCA5O60264 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SMARCA5O60264 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SMARCA5O60264 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SMARCA5O60264 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SMARCA5O60264 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SMARCA5O60264 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SMARCA5O60264 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
SMARCA5O60264 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SMARCA5O60264 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SMARCA5O60264 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SMARCA5O60264 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
SMARCA5O60264 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SMARCA5O60264 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SMARCA5O60264 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SMARCA5O60264 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SMARCA5O60264 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SMARCA5O60264 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SMARCA5O60264 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SMARCA5O60264 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SMARCA5O60264 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SMARCA5O60264 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SMARCA5O60264 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
SMARCA5O60264 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SMARCA5O60264 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SMARCA5O60264 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SMARCA5O60264 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
SMARCA5O60264 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
SMARCA5O60264 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SMARCA5O60264 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SMARCA5O60264 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SMARCA5O60264 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SMARCA5O60264 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SMARCA5O60264 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SMARCA5O60264 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
SMARCA5O60264 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
SMARCA5O60264 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SMARCA5O60264 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SMARCA5O60264 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SMARCA5O60264 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SMARCA5O60264 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SMARCA5O60264 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SMARCA5O60264 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SMARCA5O60264 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SMARCA5O60264 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SMARCA5O60264 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
SMARCA5O60264 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SMARCA5O60264 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SMARCA5O60264 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SMARCA5O60264 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SMARCA5O60264 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SMARCA5O60264 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SMARCA5O60264 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SMARCA5O60264 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SMARCA5O60264 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SMARCA5O60264 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
SMARCA5O60264 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SMARCA5O60264 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SMARCA5O60264 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SMARCA5O60264 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SMARCA5O60264 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
SMARCA5O60264 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SMARCA5O60264 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SMARCA5O60264 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SMARCA5O60264 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SMARCA5O60264 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SMARCA5O60264 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SMARCA5O60264 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
SMARCA5O60264 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SMARCA5O60264 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SMARCA5O60264 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SMARCA5O60264 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
SMARCA5O60264 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SMARCA5O60264 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
SMARCA5O60264 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SMARCA5O60264 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SMARCA5O60264 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SMARCA5O60264 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SMARCA5O60264 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SMARCA5O60264 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms