Protein–RNA interactions for Protein: O43916

CHST1, Carbohydrate sulfotransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST1O43916 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CHST1O43916 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CHST1O43916 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CHST1O43916 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CHST1O43916 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CHST1O43916 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CHST1O43916 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CHST1O43916 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CHST1O43916 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CHST1O43916 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CHST1O43916 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CHST1O43916 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CHST1O43916 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CHST1O43916 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CHST1O43916 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CHST1O43916 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CHST1O43916 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CHST1O43916 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CHST1O43916 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CHST1O43916 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CHST1O43916 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CHST1O43916 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CHST1O43916 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CHST1O43916 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CHST1O43916 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CHST1O43916 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CHST1O43916 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CHST1O43916 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHST1O43916 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHST1O43916 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CHST1O43916 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CHST1O43916 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CHST1O43916 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHST1O43916 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHST1O43916 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHST1O43916 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHST1O43916 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHST1O43916 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHST1O43916 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHST1O43916 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHST1O43916 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHST1O43916 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHST1O43916 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHST1O43916 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHST1O43916 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHST1O43916 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHST1O43916 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHST1O43916 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
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CHST1O43916 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CHST1O43916 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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CHST1O43916 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHST1O43916 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHST1O43916 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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CHST1O43916 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHST1O43916 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHST1O43916 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHST1O43916 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHST1O43916 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHST1O43916 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHST1O43916 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHST1O43916 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CHST1O43916 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CHST1O43916 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CHST1O43916 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CHST1O43916 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CHST1O43916 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CHST1O43916 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CHST1O43916 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CHST1O43916 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CHST1O43916 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CHST1O43916 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
CHST1O43916 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CHST1O43916 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CHST1O43916 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CHST1O43916 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CHST1O43916 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CHST1O43916 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CHST1O43916 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CHST1O43916 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CHST1O43916 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CHST1O43916 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CHST1O43916 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CHST1O43916 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CHST1O43916 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CHST1O43916 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
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