Protein–RNA interactions for Protein: O43711

TLX3, T-cell leukemia homeobox protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLX3O43711 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TLX3O43711 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TLX3O43711 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TLX3O43711 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TLX3O43711 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TLX3O43711 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TLX3O43711 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TLX3O43711 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TLX3O43711 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TLX3O43711 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TLX3O43711 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TLX3O43711 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TLX3O43711 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TLX3O43711 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TLX3O43711 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TLX3O43711 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TLX3O43711 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TLX3O43711 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TLX3O43711 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TLX3O43711 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TLX3O43711 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TLX3O43711 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TLX3O43711 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TLX3O43711 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TLX3O43711 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TLX3O43711 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TLX3O43711 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TLX3O43711 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TLX3O43711 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TLX3O43711 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TLX3O43711 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TLX3O43711 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TLX3O43711 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TLX3O43711 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TLX3O43711 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TLX3O43711 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TLX3O43711 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TLX3O43711 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TLX3O43711 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TLX3O43711 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TLX3O43711 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TLX3O43711 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TLX3O43711 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TLX3O43711 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TLX3O43711 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TLX3O43711 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TLX3O43711 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TLX3O43711 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TLX3O43711 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TLX3O43711 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TLX3O43711 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TLX3O43711 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TLX3O43711 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TLX3O43711 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TLX3O43711 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TLX3O43711 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TLX3O43711 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TLX3O43711 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TLX3O43711 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TLX3O43711 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TLX3O43711 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TLX3O43711 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TLX3O43711 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TLX3O43711 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TLX3O43711 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TLX3O43711 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TLX3O43711 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TLX3O43711 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TLX3O43711 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TLX3O43711 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TLX3O43711 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TLX3O43711 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TLX3O43711 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TLX3O43711 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TLX3O43711 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TLX3O43711 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TLX3O43711 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TLX3O43711 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TLX3O43711 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TLX3O43711 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TLX3O43711 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TLX3O43711 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TLX3O43711 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TLX3O43711 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TLX3O43711 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TLX3O43711 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TLX3O43711 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TLX3O43711 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TLX3O43711 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TLX3O43711 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TLX3O43711 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TLX3O43711 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TLX3O43711 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TLX3O43711 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TLX3O43711 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TLX3O43711 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TLX3O43711 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TLX3O43711 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TLX3O43711 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TLX3O43711 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms