Protein–RNA interactions for Protein: O43295

SRGAP3, SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,099 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRGAP3O43295 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SRGAP3O43295 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SRGAP3O43295 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SRGAP3O43295 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SRGAP3O43295 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SRGAP3O43295 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SRGAP3O43295 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SRGAP3O43295 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SRGAP3O43295 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SRGAP3O43295 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SRGAP3O43295 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SRGAP3O43295 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SRGAP3O43295 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SRGAP3O43295 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SRGAP3O43295 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SRGAP3O43295 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SRGAP3O43295 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SRGAP3O43295 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SRGAP3O43295 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SRGAP3O43295 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SRGAP3O43295 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SRGAP3O43295 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SRGAP3O43295 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SRGAP3O43295 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SRGAP3O43295 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SRGAP3O43295 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SRGAP3O43295 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SRGAP3O43295 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SRGAP3O43295 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SRGAP3O43295 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SRGAP3O43295 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SRGAP3O43295 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SRGAP3O43295 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SRGAP3O43295 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SRGAP3O43295 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SRGAP3O43295 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SRGAP3O43295 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SRGAP3O43295 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SRGAP3O43295 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SRGAP3O43295 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SRGAP3O43295 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SRGAP3O43295 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SRGAP3O43295 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SRGAP3O43295 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SRGAP3O43295 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SRGAP3O43295 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SRGAP3O43295 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SRGAP3O43295 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SRGAP3O43295 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SRGAP3O43295 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SRGAP3O43295 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SRGAP3O43295 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SRGAP3O43295 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SRGAP3O43295 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SRGAP3O43295 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SRGAP3O43295 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SRGAP3O43295 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SRGAP3O43295 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SRGAP3O43295 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SRGAP3O43295 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SRGAP3O43295 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SRGAP3O43295 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SRGAP3O43295 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SRGAP3O43295 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SRGAP3O43295 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SRGAP3O43295 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SRGAP3O43295 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SRGAP3O43295 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SRGAP3O43295 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SRGAP3O43295 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SRGAP3O43295 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SRGAP3O43295 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SRGAP3O43295 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SRGAP3O43295 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SRGAP3O43295 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SRGAP3O43295 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SRGAP3O43295 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SRGAP3O43295 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SRGAP3O43295 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SRGAP3O43295 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SRGAP3O43295 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SRGAP3O43295 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SRGAP3O43295 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SRGAP3O43295 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SRGAP3O43295 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SRGAP3O43295 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SRGAP3O43295 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SRGAP3O43295 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SRGAP3O43295 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SRGAP3O43295 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SRGAP3O43295 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SRGAP3O43295 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SRGAP3O43295 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SRGAP3O43295 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SRGAP3O43295 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SRGAP3O43295 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SRGAP3O43295 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SRGAP3O43295 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SRGAP3O43295 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SRGAP3O43295 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms