Protein–RNA interactions for Protein: O43272

PRODH, Proline dehydrogenase 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 600 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRODHO43272 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRODHO43272 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRODHO43272 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRODHO43272 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRODHO43272 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRODHO43272 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRODHO43272 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRODHO43272 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRODHO43272 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRODHO43272 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRODHO43272 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRODHO43272 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRODHO43272 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRODHO43272 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRODHO43272 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRODHO43272 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRODHO43272 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PRODHO43272 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRODHO43272 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRODHO43272 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRODHO43272 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRODHO43272 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRODHO43272 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRODHO43272 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRODHO43272 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRODHO43272 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRODHO43272 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRODHO43272 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRODHO43272 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRODHO43272 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRODHO43272 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRODHO43272 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRODHO43272 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRODHO43272 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRODHO43272 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRODHO43272 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRODHO43272 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRODHO43272 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRODHO43272 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRODHO43272 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRODHO43272 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRODHO43272 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRODHO43272 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRODHO43272 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRODHO43272 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRODHO43272 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRODHO43272 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
PRODHO43272 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PRODHO43272 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
PRODHO43272 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PRODHO43272 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
PRODHO43272 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
PRODHO43272 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PRODHO43272 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
PRODHO43272 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PRODHO43272 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRODHO43272 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRODHO43272 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRODHO43272 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRODHO43272 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRODHO43272 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRODHO43272 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRODHO43272 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRODHO43272 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRODHO43272 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRODHO43272 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
PRODHO43272 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRODHO43272 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRODHO43272 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
PRODHO43272 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
PRODHO43272 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRODHO43272 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRODHO43272 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRODHO43272 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRODHO43272 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRODHO43272 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRODHO43272 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRODHO43272 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRODHO43272 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRODHO43272 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRODHO43272 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRODHO43272 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRODHO43272 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRODHO43272 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRODHO43272 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRODHO43272 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRODHO43272 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRODHO43272 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRODHO43272 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRODHO43272 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRODHO43272 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRODHO43272 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRODHO43272 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRODHO43272 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRODHO43272 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRODHO43272 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PRODHO43272 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PRODHO43272 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PRODHO43272 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PRODHO43272 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms