Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
PTPRTO14522 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
PTPRTO14522 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
PTPRTO14522 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
PTPRTO14522 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.59
PTPRTO14522 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
PTPRTO14522 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.59
PTPRTO14522 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
PTPRTO14522 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
PTPRTO14522 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PTPRTO14522 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PTPRTO14522 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PTPRTO14522 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PTPRTO14522 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PTPRTO14522 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PTPRTO14522 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PTPRTO14522 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
PTPRTO14522 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PTPRTO14522 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PTPRTO14522 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
PTPRTO14522 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
PTPRTO14522 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PTPRTO14522 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTPRTO14522 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTPRTO14522 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTPRTO14522 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTPRTO14522 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTPRTO14522 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTPRTO14522 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PTPRTO14522 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PTPRTO14522 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTPRTO14522 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTPRTO14522 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTPRTO14522 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTPRTO14522 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTPRTO14522 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PTPRTO14522 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTPRTO14522 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTPRTO14522 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTPRTO14522 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTPRTO14522 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTPRTO14522 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTPRTO14522 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTPRTO14522 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTPRTO14522 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTPRTO14522 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTPRTO14522 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTPRTO14522 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTPRTO14522 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTPRTO14522 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTPRTO14522 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTPRTO14522 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTPRTO14522 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTPRTO14522 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTPRTO14522 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
PTPRTO14522 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
PTPRTO14522 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTPRTO14522 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTPRTO14522 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTPRTO14522 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTPRTO14522 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTPRTO14522 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTPRTO14522 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTPRTO14522 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTPRTO14522 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTPRTO14522 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTPRTO14522 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTPRTO14522 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTPRTO14522 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTPRTO14522 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTPRTO14522 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTPRTO14522 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTPRTO14522 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTPRTO14522 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
PTPRTO14522 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
PTPRTO14522 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTPRTO14522 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTPRTO14522 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTPRTO14522 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTPRTO14522 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTPRTO14522 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTPRTO14522 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTPRTO14522 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTPRTO14522 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTPRTO14522 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTPRTO14522 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTPRTO14522 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
PTPRTO14522 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTPRTO14522 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTPRTO14522 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTPRTO14522 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTPRTO14522 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTPRTO14522 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTPRTO14522 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTPRTO14522 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
PTPRTO14522 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
PTPRTO14522 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
PTPRTO14522 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTPRTO14522 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTPRTO14522 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
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