Protein–RNA interactions for Protein: A3KMH1

VWA8, von Willebrand factor A domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,905 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA8A3KMH1 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
VWA8A3KMH1 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VWA8A3KMH1 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
VWA8A3KMH1 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
VWA8A3KMH1 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VWA8A3KMH1 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VWA8A3KMH1 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VWA8A3KMH1 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VWA8A3KMH1 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VWA8A3KMH1 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VWA8A3KMH1 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
VWA8A3KMH1 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC18■□□□□ 0.47
VWA8A3KMH1 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VWA8A3KMH1 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
VWA8A3KMH1 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
VWA8A3KMH1 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
VWA8A3KMH1 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VWA8A3KMH1 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC18■□□□□ 0.47
VWA8A3KMH1 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
VWA8A3KMH1 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VWA8A3KMH1 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VWA8A3KMH1 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VWA8A3KMH1 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VWA8A3KMH1 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VWA8A3KMH1 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VWA8A3KMH1 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VWA8A3KMH1 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VWA8A3KMH1 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VWA8A3KMH1 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VWA8A3KMH1 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VWA8A3KMH1 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VWA8A3KMH1 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VWA8A3KMH1 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VWA8A3KMH1 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VWA8A3KMH1 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VWA8A3KMH1 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
VWA8A3KMH1 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VWA8A3KMH1 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VWA8A3KMH1 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VWA8A3KMH1 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
VWA8A3KMH1 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VWA8A3KMH1 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VWA8A3KMH1 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VWA8A3KMH1 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VWA8A3KMH1 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VWA8A3KMH1 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VWA8A3KMH1 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VWA8A3KMH1 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VWA8A3KMH1 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VWA8A3KMH1 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VWA8A3KMH1 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VWA8A3KMH1 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VWA8A3KMH1 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VWA8A3KMH1 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VWA8A3KMH1 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VWA8A3KMH1 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VWA8A3KMH1 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VWA8A3KMH1 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VWA8A3KMH1 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VWA8A3KMH1 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
VWA8A3KMH1 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VWA8A3KMH1 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
VWA8A3KMH1 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VWA8A3KMH1 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VWA8A3KMH1 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VWA8A3KMH1 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
VWA8A3KMH1 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VWA8A3KMH1 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VWA8A3KMH1 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VWA8A3KMH1 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VWA8A3KMH1 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
VWA8A3KMH1 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
VWA8A3KMH1 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VWA8A3KMH1 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VWA8A3KMH1 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VWA8A3KMH1 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VWA8A3KMH1 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VWA8A3KMH1 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VWA8A3KMH1 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VWA8A3KMH1 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VWA8A3KMH1 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VWA8A3KMH1 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VWA8A3KMH1 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VWA8A3KMH1 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
VWA8A3KMH1 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VWA8A3KMH1 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VWA8A3KMH1 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VWA8A3KMH1 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VWA8A3KMH1 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VWA8A3KMH1 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VWA8A3KMH1 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VWA8A3KMH1 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VWA8A3KMH1 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VWA8A3KMH1 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
VWA8A3KMH1 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
VWA8A3KMH1 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VWA8A3KMH1 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VWA8A3KMH1 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
VWA8A3KMH1 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
VWA8A3KMH1 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms