Protein–RNA interactions for Protein: A2VEC9

SSPO, SCO-spondin, humanhuman

Predictions only

Length 5,147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPOA2VEC9 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
SSPOA2VEC9 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
SSPOA2VEC9 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SSPOA2VEC9 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SSPOA2VEC9 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SSPOA2VEC9 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SSPOA2VEC9 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SSPOA2VEC9 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
SSPOA2VEC9 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
SSPOA2VEC9 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
SSPOA2VEC9 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SSPOA2VEC9 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
SSPOA2VEC9 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
SSPOA2VEC9 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
SSPOA2VEC9 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
SSPOA2VEC9 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
SSPOA2VEC9 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
SSPOA2VEC9 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
SSPOA2VEC9 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
SSPOA2VEC9 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
SSPOA2VEC9 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
SSPOA2VEC9 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
SSPOA2VEC9 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
SSPOA2VEC9 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
SSPOA2VEC9 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
SSPOA2VEC9 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
SSPOA2VEC9 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
SSPOA2VEC9 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
SSPOA2VEC9 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
SSPOA2VEC9 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
SSPOA2VEC9 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
SSPOA2VEC9 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
SSPOA2VEC9 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
SSPOA2VEC9 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
SSPOA2VEC9 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
SSPOA2VEC9 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
SSPOA2VEC9 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
SSPOA2VEC9 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
SSPOA2VEC9 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
SSPOA2VEC9 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
SSPOA2VEC9 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
SSPOA2VEC9 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
SSPOA2VEC9 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
SSPOA2VEC9 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
SSPOA2VEC9 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
SSPOA2VEC9 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
SSPOA2VEC9 AC073094.1-201ENST00000453798 433 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
SSPOA2VEC9 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC7.43□□□□□ -1.22
SSPOA2VEC9 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.43□□□□□ -1.22
SSPOA2VEC9 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
SSPOA2VEC9 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
SSPOA2VEC9 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
SSPOA2VEC9 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
SSPOA2VEC9 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
SSPOA2VEC9 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
SSPOA2VEC9 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
SSPOA2VEC9 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
SSPOA2VEC9 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC7.43□□□□□ -1.22
SSPOA2VEC9 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
SSPOA2VEC9 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
SSPOA2VEC9 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
SSPOA2VEC9 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
SSPOA2VEC9 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
SSPOA2VEC9 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
SSPOA2VEC9 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
SSPOA2VEC9 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
SSPOA2VEC9 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
SSPOA2VEC9 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
SSPOA2VEC9 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
SSPOA2VEC9 LHFPL3-201ENST00000401970 1378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
SSPOA2VEC9 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
SSPOA2VEC9 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
SSPOA2VEC9 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
SSPOA2VEC9 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
SSPOA2VEC9 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
SSPOA2VEC9 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
SSPOA2VEC9 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
SSPOA2VEC9 TMEM242-201ENST00000367144 1030 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
SSPOA2VEC9 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
SSPOA2VEC9 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
SSPOA2VEC9 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
SSPOA2VEC9 AC104784.1-201ENST00000473096 294 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
SSPOA2VEC9 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
SSPOA2VEC9 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
SSPOA2VEC9 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
SSPOA2VEC9 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
SSPOA2VEC9 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
SSPOA2VEC9 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
SSPOA2VEC9 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
SSPOA2VEC9 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
SSPOA2VEC9 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
SSPOA2VEC9 AC026904.3-201ENST00000636550 1530 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
SSPOA2VEC9 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
SSPOA2VEC9 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
SSPOA2VEC9 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
SSPOA2VEC9 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
SSPOA2VEC9 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
SSPOA2VEC9 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
SSPOA2VEC9 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
SSPOA2VEC9 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.7 ms