Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6C7

LINC00312, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00312, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00312Q9Y6C7 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC14.3□□□□□ -0.12
LINC00312Q9Y6C7 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
LINC00312Q9Y6C7 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
LINC00312Q9Y6C7 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC14.3□□□□□ -0.12
LINC00312Q9Y6C7 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
LINC00312Q9Y6C7 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
LINC00312Q9Y6C7 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
LINC00312Q9Y6C7 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
LINC00312Q9Y6C7 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
LINC00312Q9Y6C7 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
LINC00312Q9Y6C7 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
LINC00312Q9Y6C7 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
LINC00312Q9Y6C7 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
LINC00312Q9Y6C7 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
LINC00312Q9Y6C7 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
LINC00312Q9Y6C7 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
LINC00312Q9Y6C7 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
LINC00312Q9Y6C7 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
LINC00312Q9Y6C7 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
LINC00312Q9Y6C7 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
LINC00312Q9Y6C7 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
LINC00312Q9Y6C7 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
LINC00312Q9Y6C7 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
LINC00312Q9Y6C7 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
LINC00312Q9Y6C7 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
LINC00312Q9Y6C7 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
LINC00312Q9Y6C7 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
LINC00312Q9Y6C7 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
LINC00312Q9Y6C7 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
LINC00312Q9Y6C7 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
LINC00312Q9Y6C7 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
LINC00312Q9Y6C7 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
LINC00312Q9Y6C7 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
LINC00312Q9Y6C7 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
LINC00312Q9Y6C7 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
LINC00312Q9Y6C7 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
LINC00312Q9Y6C7 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
LINC00312Q9Y6C7 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
LINC00312Q9Y6C7 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
LINC00312Q9Y6C7 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
LINC00312Q9Y6C7 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
LINC00312Q9Y6C7 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
LINC00312Q9Y6C7 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
LINC00312Q9Y6C7 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
LINC00312Q9Y6C7 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
LINC00312Q9Y6C7 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
LINC00312Q9Y6C7 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC14.29□□□□□ -0.12
LINC00312Q9Y6C7 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
LINC00312Q9Y6C7 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
LINC00312Q9Y6C7 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
LINC00312Q9Y6C7 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
LINC00312Q9Y6C7 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
LINC00312Q9Y6C7 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
LINC00312Q9Y6C7 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
LINC00312Q9Y6C7 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
LINC00312Q9Y6C7 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
LINC00312Q9Y6C7 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
LINC00312Q9Y6C7 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
LINC00312Q9Y6C7 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
LINC00312Q9Y6C7 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
LINC00312Q9Y6C7 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
LINC00312Q9Y6C7 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
LINC00312Q9Y6C7 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
LINC00312Q9Y6C7 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
LINC00312Q9Y6C7 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
LINC00312Q9Y6C7 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
LINC00312Q9Y6C7 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
LINC00312Q9Y6C7 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
LINC00312Q9Y6C7 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
LINC00312Q9Y6C7 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
LINC00312Q9Y6C7 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
LINC00312Q9Y6C7 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
LINC00312Q9Y6C7 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
LINC00312Q9Y6C7 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
LINC00312Q9Y6C7 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC14.28□□□□□ -0.12
LINC00312Q9Y6C7 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
LINC00312Q9Y6C7 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
LINC00312Q9Y6C7 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
LINC00312Q9Y6C7 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
LINC00312Q9Y6C7 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
LINC00312Q9Y6C7 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
LINC00312Q9Y6C7 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
LINC00312Q9Y6C7 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
LINC00312Q9Y6C7 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
LINC00312Q9Y6C7 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
LINC00312Q9Y6C7 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
LINC00312Q9Y6C7 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
LINC00312Q9Y6C7 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
LINC00312Q9Y6C7 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
LINC00312Q9Y6C7 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
LINC00312Q9Y6C7 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
LINC00312Q9Y6C7 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC14.28□□□□□ -0.12
LINC00312Q9Y6C7 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
LINC00312Q9Y6C7 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
LINC00312Q9Y6C7 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
LINC00312Q9Y6C7 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
LINC00312Q9Y6C7 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
LINC00312Q9Y6C7 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
LINC00312Q9Y6C7 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
LINC00312Q9Y6C7 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.1 ms