Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPS6

SETD1B, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD1BQ9UPS6 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SETD1BQ9UPS6 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SETD1BQ9UPS6 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SETD1BQ9UPS6 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SETD1BQ9UPS6 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SETD1BQ9UPS6 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SETD1BQ9UPS6 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SETD1BQ9UPS6 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SETD1BQ9UPS6 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SETD1BQ9UPS6 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SETD1BQ9UPS6 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SETD1BQ9UPS6 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SETD1BQ9UPS6 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SETD1BQ9UPS6 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SETD1BQ9UPS6 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SETD1BQ9UPS6 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SETD1BQ9UPS6 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SETD1BQ9UPS6 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SETD1BQ9UPS6 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SETD1BQ9UPS6 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SETD1BQ9UPS6 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SETD1BQ9UPS6 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SETD1BQ9UPS6 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SETD1BQ9UPS6 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SETD1BQ9UPS6 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SETD1BQ9UPS6 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SETD1BQ9UPS6 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SETD1BQ9UPS6 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SETD1BQ9UPS6 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SETD1BQ9UPS6 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SETD1BQ9UPS6 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SETD1BQ9UPS6 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SETD1BQ9UPS6 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SETD1BQ9UPS6 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SETD1BQ9UPS6 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SETD1BQ9UPS6 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SETD1BQ9UPS6 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SETD1BQ9UPS6 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SETD1BQ9UPS6 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SETD1BQ9UPS6 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SETD1BQ9UPS6 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SETD1BQ9UPS6 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SETD1BQ9UPS6 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SETD1BQ9UPS6 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SETD1BQ9UPS6 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SETD1BQ9UPS6 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SETD1BQ9UPS6 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SETD1BQ9UPS6 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SETD1BQ9UPS6 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SETD1BQ9UPS6 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SETD1BQ9UPS6 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SETD1BQ9UPS6 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SETD1BQ9UPS6 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SETD1BQ9UPS6 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SETD1BQ9UPS6 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SETD1BQ9UPS6 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SETD1BQ9UPS6 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SETD1BQ9UPS6 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SETD1BQ9UPS6 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SETD1BQ9UPS6 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SETD1BQ9UPS6 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SETD1BQ9UPS6 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SETD1BQ9UPS6 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SETD1BQ9UPS6 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SETD1BQ9UPS6 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SETD1BQ9UPS6 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SETD1BQ9UPS6 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SETD1BQ9UPS6 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SETD1BQ9UPS6 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SETD1BQ9UPS6 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SETD1BQ9UPS6 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SETD1BQ9UPS6 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SETD1BQ9UPS6 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SETD1BQ9UPS6 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SETD1BQ9UPS6 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SETD1BQ9UPS6 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SETD1BQ9UPS6 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SETD1BQ9UPS6 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SETD1BQ9UPS6 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SETD1BQ9UPS6 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SETD1BQ9UPS6 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SETD1BQ9UPS6 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SETD1BQ9UPS6 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SETD1BQ9UPS6 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SETD1BQ9UPS6 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SETD1BQ9UPS6 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SETD1BQ9UPS6 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SETD1BQ9UPS6 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SETD1BQ9UPS6 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SETD1BQ9UPS6 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SETD1BQ9UPS6 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SETD1BQ9UPS6 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SETD1BQ9UPS6 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SETD1BQ9UPS6 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SETD1BQ9UPS6 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SETD1BQ9UPS6 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SETD1BQ9UPS6 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SETD1BQ9UPS6 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SETD1BQ9UPS6 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SETD1BQ9UPS6 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms