Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ4

TRIM35, Tripartite motif-containing protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM35Q9UPQ4 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM35Q9UPQ4 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM35Q9UPQ4 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM35Q9UPQ4 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM35Q9UPQ4 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM35Q9UPQ4 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM35Q9UPQ4 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM35Q9UPQ4 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM35Q9UPQ4 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM35Q9UPQ4 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM35Q9UPQ4 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM35Q9UPQ4 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM35Q9UPQ4 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM35Q9UPQ4 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM35Q9UPQ4 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM35Q9UPQ4 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM35Q9UPQ4 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM35Q9UPQ4 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM35Q9UPQ4 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM35Q9UPQ4 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM35Q9UPQ4 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM35Q9UPQ4 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM35Q9UPQ4 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM35Q9UPQ4 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM35Q9UPQ4 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM35Q9UPQ4 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM35Q9UPQ4 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM35Q9UPQ4 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM35Q9UPQ4 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM35Q9UPQ4 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM35Q9UPQ4 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM35Q9UPQ4 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM35Q9UPQ4 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM35Q9UPQ4 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM35Q9UPQ4 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM35Q9UPQ4 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM35Q9UPQ4 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM35Q9UPQ4 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM35Q9UPQ4 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM35Q9UPQ4 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM35Q9UPQ4 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM35Q9UPQ4 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM35Q9UPQ4 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM35Q9UPQ4 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TRIM35Q9UPQ4 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
TRIM35Q9UPQ4 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TRIM35Q9UPQ4 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TRIM35Q9UPQ4 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TRIM35Q9UPQ4 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TRIM35Q9UPQ4 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TRIM35Q9UPQ4 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIM35Q9UPQ4 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIM35Q9UPQ4 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIM35Q9UPQ4 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIM35Q9UPQ4 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIM35Q9UPQ4 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIM35Q9UPQ4 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIM35Q9UPQ4 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIM35Q9UPQ4 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIM35Q9UPQ4 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIM35Q9UPQ4 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIM35Q9UPQ4 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIM35Q9UPQ4 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIM35Q9UPQ4 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIM35Q9UPQ4 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIM35Q9UPQ4 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIM35Q9UPQ4 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIM35Q9UPQ4 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIM35Q9UPQ4 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIM35Q9UPQ4 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIM35Q9UPQ4 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIM35Q9UPQ4 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM35Q9UPQ4 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM35Q9UPQ4 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM35Q9UPQ4 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM35Q9UPQ4 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM35Q9UPQ4 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM35Q9UPQ4 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM35Q9UPQ4 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM35Q9UPQ4 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM35Q9UPQ4 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM35Q9UPQ4 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM35Q9UPQ4 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM35Q9UPQ4 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM35Q9UPQ4 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM35Q9UPQ4 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM35Q9UPQ4 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM35Q9UPQ4 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM35Q9UPQ4 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM35Q9UPQ4 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM35Q9UPQ4 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM35Q9UPQ4 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM35Q9UPQ4 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM35Q9UPQ4 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM35Q9UPQ4 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM35Q9UPQ4 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM35Q9UPQ4 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM35Q9UPQ4 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM35Q9UPQ4 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM35Q9UPQ4 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms