Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN30

SCML1, Sex comb on midleg-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCML1Q9UN30 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SCML1Q9UN30 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCML1Q9UN30 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCML1Q9UN30 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCML1Q9UN30 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCML1Q9UN30 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCML1Q9UN30 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCML1Q9UN30 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCML1Q9UN30 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCML1Q9UN30 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCML1Q9UN30 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCML1Q9UN30 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCML1Q9UN30 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCML1Q9UN30 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCML1Q9UN30 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SCML1Q9UN30 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SCML1Q9UN30 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCML1Q9UN30 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCML1Q9UN30 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCML1Q9UN30 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCML1Q9UN30 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCML1Q9UN30 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCML1Q9UN30 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCML1Q9UN30 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCML1Q9UN30 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SCML1Q9UN30 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCML1Q9UN30 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCML1Q9UN30 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCML1Q9UN30 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCML1Q9UN30 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCML1Q9UN30 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCML1Q9UN30 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCML1Q9UN30 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCML1Q9UN30 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCML1Q9UN30 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCML1Q9UN30 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCML1Q9UN30 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SCML1Q9UN30 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCML1Q9UN30 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCML1Q9UN30 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCML1Q9UN30 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCML1Q9UN30 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCML1Q9UN30 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCML1Q9UN30 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCML1Q9UN30 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCML1Q9UN30 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCML1Q9UN30 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCML1Q9UN30 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SCML1Q9UN30 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCML1Q9UN30 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCML1Q9UN30 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCML1Q9UN30 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCML1Q9UN30 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCML1Q9UN30 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCML1Q9UN30 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCML1Q9UN30 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCML1Q9UN30 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SCML1Q9UN30 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCML1Q9UN30 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCML1Q9UN30 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SCML1Q9UN30 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SCML1Q9UN30 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SCML1Q9UN30 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCML1Q9UN30 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCML1Q9UN30 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCML1Q9UN30 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCML1Q9UN30 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCML1Q9UN30 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCML1Q9UN30 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCML1Q9UN30 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SCML1Q9UN30 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCML1Q9UN30 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCML1Q9UN30 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCML1Q9UN30 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCML1Q9UN30 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCML1Q9UN30 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCML1Q9UN30 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCML1Q9UN30 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCML1Q9UN30 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCML1Q9UN30 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCML1Q9UN30 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCML1Q9UN30 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCML1Q9UN30 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCML1Q9UN30 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCML1Q9UN30 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCML1Q9UN30 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCML1Q9UN30 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCML1Q9UN30 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCML1Q9UN30 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCML1Q9UN30 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SCML1Q9UN30 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCML1Q9UN30 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SCML1Q9UN30 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SCML1Q9UN30 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCML1Q9UN30 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCML1Q9UN30 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCML1Q9UN30 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCML1Q9UN30 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCML1Q9UN30 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCML1Q9UN30 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms