Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD4

BRPF3, Bromodomain and PHD finger-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF3Q9ULD4 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
BRPF3Q9ULD4 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
BRPF3Q9ULD4 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
BRPF3Q9ULD4 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BRPF3Q9ULD4 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BRPF3Q9ULD4 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BRPF3Q9ULD4 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BRPF3Q9ULD4 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
BRPF3Q9ULD4 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BRPF3Q9ULD4 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
BRPF3Q9ULD4 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BRPF3Q9ULD4 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BRPF3Q9ULD4 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BRPF3Q9ULD4 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BRPF3Q9ULD4 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BRPF3Q9ULD4 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BRPF3Q9ULD4 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BRPF3Q9ULD4 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
BRPF3Q9ULD4 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
BRPF3Q9ULD4 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BRPF3Q9ULD4 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
BRPF3Q9ULD4 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BRPF3Q9ULD4 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BRPF3Q9ULD4 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BRPF3Q9ULD4 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
BRPF3Q9ULD4 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
BRPF3Q9ULD4 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
BRPF3Q9ULD4 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
BRPF3Q9ULD4 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
BRPF3Q9ULD4 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BRPF3Q9ULD4 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BRPF3Q9ULD4 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BRPF3Q9ULD4 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BRPF3Q9ULD4 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
BRPF3Q9ULD4 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BRPF3Q9ULD4 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
BRPF3Q9ULD4 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BRPF3Q9ULD4 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BRPF3Q9ULD4 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BRPF3Q9ULD4 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BRPF3Q9ULD4 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
BRPF3Q9ULD4 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BRPF3Q9ULD4 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
BRPF3Q9ULD4 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
BRPF3Q9ULD4 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
BRPF3Q9ULD4 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
BRPF3Q9ULD4 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
BRPF3Q9ULD4 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
BRPF3Q9ULD4 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
BRPF3Q9ULD4 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BRPF3Q9ULD4 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BRPF3Q9ULD4 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BRPF3Q9ULD4 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
BRPF3Q9ULD4 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BRPF3Q9ULD4 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BRPF3Q9ULD4 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BRPF3Q9ULD4 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BRPF3Q9ULD4 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
BRPF3Q9ULD4 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
BRPF3Q9ULD4 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
BRPF3Q9ULD4 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
BRPF3Q9ULD4 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
BRPF3Q9ULD4 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
BRPF3Q9ULD4 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
BRPF3Q9ULD4 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
BRPF3Q9ULD4 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
BRPF3Q9ULD4 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
BRPF3Q9ULD4 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
BRPF3Q9ULD4 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
BRPF3Q9ULD4 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
BRPF3Q9ULD4 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
BRPF3Q9ULD4 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
BRPF3Q9ULD4 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
BRPF3Q9ULD4 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
BRPF3Q9ULD4 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
BRPF3Q9ULD4 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
BRPF3Q9ULD4 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
BRPF3Q9ULD4 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
BRPF3Q9ULD4 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
BRPF3Q9ULD4 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
BRPF3Q9ULD4 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
BRPF3Q9ULD4 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
BRPF3Q9ULD4 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
BRPF3Q9ULD4 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
BRPF3Q9ULD4 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.96
BRPF3Q9ULD4 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
BRPF3Q9ULD4 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
BRPF3Q9ULD4 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
BRPF3Q9ULD4 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
BRPF3Q9ULD4 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
BRPF3Q9ULD4 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
BRPF3Q9ULD4 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
BRPF3Q9ULD4 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
BRPF3Q9ULD4 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
BRPF3Q9ULD4 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
BRPF3Q9ULD4 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
BRPF3Q9ULD4 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
BRPF3Q9ULD4 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
BRPF3Q9ULD4 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
BRPF3Q9ULD4 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms