Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIK5

TMEFF2, Tomoregulin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEFF2Q9UIK5 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEFF2Q9UIK5 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEFF2Q9UIK5 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEFF2Q9UIK5 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEFF2Q9UIK5 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEFF2Q9UIK5 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEFF2Q9UIK5 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEFF2Q9UIK5 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEFF2Q9UIK5 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEFF2Q9UIK5 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEFF2Q9UIK5 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEFF2Q9UIK5 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEFF2Q9UIK5 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEFF2Q9UIK5 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEFF2Q9UIK5 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEFF2Q9UIK5 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEFF2Q9UIK5 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEFF2Q9UIK5 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEFF2Q9UIK5 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEFF2Q9UIK5 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEFF2Q9UIK5 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEFF2Q9UIK5 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEFF2Q9UIK5 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEFF2Q9UIK5 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEFF2Q9UIK5 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEFF2Q9UIK5 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEFF2Q9UIK5 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEFF2Q9UIK5 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEFF2Q9UIK5 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEFF2Q9UIK5 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEFF2Q9UIK5 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEFF2Q9UIK5 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEFF2Q9UIK5 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEFF2Q9UIK5 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEFF2Q9UIK5 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEFF2Q9UIK5 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEFF2Q9UIK5 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEFF2Q9UIK5 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEFF2Q9UIK5 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEFF2Q9UIK5 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEFF2Q9UIK5 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEFF2Q9UIK5 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEFF2Q9UIK5 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEFF2Q9UIK5 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEFF2Q9UIK5 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEFF2Q9UIK5 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEFF2Q9UIK5 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEFF2Q9UIK5 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEFF2Q9UIK5 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEFF2Q9UIK5 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEFF2Q9UIK5 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEFF2Q9UIK5 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEFF2Q9UIK5 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEFF2Q9UIK5 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEFF2Q9UIK5 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEFF2Q9UIK5 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEFF2Q9UIK5 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEFF2Q9UIK5 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEFF2Q9UIK5 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEFF2Q9UIK5 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEFF2Q9UIK5 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEFF2Q9UIK5 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEFF2Q9UIK5 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEFF2Q9UIK5 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEFF2Q9UIK5 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEFF2Q9UIK5 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEFF2Q9UIK5 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEFF2Q9UIK5 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEFF2Q9UIK5 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEFF2Q9UIK5 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEFF2Q9UIK5 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEFF2Q9UIK5 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEFF2Q9UIK5 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEFF2Q9UIK5 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEFF2Q9UIK5 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEFF2Q9UIK5 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEFF2Q9UIK5 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEFF2Q9UIK5 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEFF2Q9UIK5 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEFF2Q9UIK5 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEFF2Q9UIK5 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEFF2Q9UIK5 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEFF2Q9UIK5 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEFF2Q9UIK5 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEFF2Q9UIK5 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEFF2Q9UIK5 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEFF2Q9UIK5 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEFF2Q9UIK5 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEFF2Q9UIK5 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEFF2Q9UIK5 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEFF2Q9UIK5 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEFF2Q9UIK5 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEFF2Q9UIK5 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEFF2Q9UIK5 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEFF2Q9UIK5 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEFF2Q9UIK5 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEFF2Q9UIK5 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEFF2Q9UIK5 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEFF2Q9UIK5 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEFF2Q9UIK5 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms