Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBD3

XCL2, Cytokine SCM-1 beta, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XCL2Q9UBD3 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
XCL2Q9UBD3 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
XCL2Q9UBD3 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
XCL2Q9UBD3 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
XCL2Q9UBD3 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
XCL2Q9UBD3 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
XCL2Q9UBD3 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
XCL2Q9UBD3 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
XCL2Q9UBD3 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
XCL2Q9UBD3 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
XCL2Q9UBD3 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
XCL2Q9UBD3 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
XCL2Q9UBD3 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
XCL2Q9UBD3 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
XCL2Q9UBD3 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
XCL2Q9UBD3 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
XCL2Q9UBD3 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
XCL2Q9UBD3 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
XCL2Q9UBD3 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
XCL2Q9UBD3 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
XCL2Q9UBD3 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
XCL2Q9UBD3 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
XCL2Q9UBD3 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
XCL2Q9UBD3 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
XCL2Q9UBD3 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
XCL2Q9UBD3 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
XCL2Q9UBD3 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC12.85□□□□□ -0.35
XCL2Q9UBD3 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
XCL2Q9UBD3 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
XCL2Q9UBD3 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
XCL2Q9UBD3 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
XCL2Q9UBD3 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
XCL2Q9UBD3 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
XCL2Q9UBD3 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
XCL2Q9UBD3 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
XCL2Q9UBD3 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
XCL2Q9UBD3 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
XCL2Q9UBD3 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
XCL2Q9UBD3 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
XCL2Q9UBD3 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
XCL2Q9UBD3 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
XCL2Q9UBD3 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
XCL2Q9UBD3 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
XCL2Q9UBD3 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
XCL2Q9UBD3 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
XCL2Q9UBD3 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
XCL2Q9UBD3 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
XCL2Q9UBD3 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
XCL2Q9UBD3 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
XCL2Q9UBD3 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
XCL2Q9UBD3 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
XCL2Q9UBD3 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
XCL2Q9UBD3 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
XCL2Q9UBD3 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
XCL2Q9UBD3 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
XCL2Q9UBD3 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
XCL2Q9UBD3 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
XCL2Q9UBD3 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
XCL2Q9UBD3 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
XCL2Q9UBD3 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
XCL2Q9UBD3 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
XCL2Q9UBD3 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
XCL2Q9UBD3 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
XCL2Q9UBD3 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
XCL2Q9UBD3 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
XCL2Q9UBD3 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
XCL2Q9UBD3 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
XCL2Q9UBD3 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
XCL2Q9UBD3 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
XCL2Q9UBD3 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
XCL2Q9UBD3 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
XCL2Q9UBD3 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
XCL2Q9UBD3 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
XCL2Q9UBD3 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
XCL2Q9UBD3 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
XCL2Q9UBD3 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
XCL2Q9UBD3 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
XCL2Q9UBD3 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
XCL2Q9UBD3 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
XCL2Q9UBD3 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
XCL2Q9UBD3 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
XCL2Q9UBD3 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
XCL2Q9UBD3 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
XCL2Q9UBD3 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
XCL2Q9UBD3 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
XCL2Q9UBD3 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
XCL2Q9UBD3 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
XCL2Q9UBD3 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
XCL2Q9UBD3 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
XCL2Q9UBD3 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
XCL2Q9UBD3 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
XCL2Q9UBD3 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
XCL2Q9UBD3 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
XCL2Q9UBD3 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
XCL2Q9UBD3 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
XCL2Q9UBD3 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
XCL2Q9UBD3 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
XCL2Q9UBD3 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.83□□□□□ -0.35
XCL2Q9UBD3 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.35
XCL2Q9UBD3 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms