Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z9

CCDC180, Coiled-coil domain-containing protein 180, humanhuman

Predictions only

Length 1,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC180Q9P1Z9 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.81■■■■□ 3.16
CCDC180Q9P1Z9 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.8■■■■□ 3.16
CCDC180Q9P1Z9 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC34.8■■■■□ 3.16
CCDC180Q9P1Z9 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC34.8■■■■□ 3.16
CCDC180Q9P1Z9 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
CCDC180Q9P1Z9 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
CCDC180Q9P1Z9 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC34.8■■■■□ 3.16
CCDC180Q9P1Z9 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC34.8■■■■□ 3.16
CCDC180Q9P1Z9 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC34.8■■■■□ 3.16
CCDC180Q9P1Z9 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
CCDC180Q9P1Z9 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC34.8■■■■□ 3.16
CCDC180Q9P1Z9 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.8■■■■□ 3.16
CCDC180Q9P1Z9 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC34.8■■■■□ 3.16
CCDC180Q9P1Z9 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.8■■■■□ 3.16
CCDC180Q9P1Z9 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC34.8■■■■□ 3.16
CCDC180Q9P1Z9 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
CCDC180Q9P1Z9 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
CCDC180Q9P1Z9 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
CCDC180Q9P1Z9 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.79■■■■□ 3.16
CCDC180Q9P1Z9 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
CCDC180Q9P1Z9 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC34.79■■■■□ 3.16
CCDC180Q9P1Z9 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC34.79■■■■□ 3.16
CCDC180Q9P1Z9 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC34.79■■■■□ 3.16
CCDC180Q9P1Z9 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC34.79■■■■□ 3.16
CCDC180Q9P1Z9 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC34.79■■■■□ 3.16
CCDC180Q9P1Z9 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
CCDC180Q9P1Z9 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC34.79■■■■□ 3.16
CCDC180Q9P1Z9 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
CCDC180Q9P1Z9 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC34.79■■■■□ 3.16
CCDC180Q9P1Z9 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC34.78■■■■□ 3.16
CCDC180Q9P1Z9 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
CCDC180Q9P1Z9 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC34.78■■■■□ 3.16
CCDC180Q9P1Z9 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
CCDC180Q9P1Z9 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC34.78■■■■□ 3.16
CCDC180Q9P1Z9 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
CCDC180Q9P1Z9 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
CCDC180Q9P1Z9 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC34.78■■■■□ 3.16
CCDC180Q9P1Z9 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC34.78■■■■□ 3.16
CCDC180Q9P1Z9 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC34.78■■■■□ 3.16
CCDC180Q9P1Z9 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
CCDC180Q9P1Z9 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC34.78■■■■□ 3.16
CCDC180Q9P1Z9 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
CCDC180Q9P1Z9 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
CCDC180Q9P1Z9 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
CCDC180Q9P1Z9 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC34.77■■■■□ 3.16
CCDC180Q9P1Z9 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
CCDC180Q9P1Z9 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC34.77■■■■□ 3.16
CCDC180Q9P1Z9 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC34.77■■■■□ 3.16
CCDC180Q9P1Z9 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC34.77■■■■□ 3.16
CCDC180Q9P1Z9 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC34.77■■■■□ 3.16
CCDC180Q9P1Z9 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.77■■■■□ 3.16
CCDC180Q9P1Z9 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.77■■■■□ 3.16
CCDC180Q9P1Z9 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
CCDC180Q9P1Z9 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
CCDC180Q9P1Z9 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC34.77■■■■□ 3.16
CCDC180Q9P1Z9 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC34.77■■■■□ 3.16
CCDC180Q9P1Z9 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC34.77■■■■□ 3.16
CCDC180Q9P1Z9 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
CCDC180Q9P1Z9 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC34.77■■■■□ 3.16
CCDC180Q9P1Z9 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
CCDC180Q9P1Z9 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC34.77■■■■□ 3.16
CCDC180Q9P1Z9 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.76■■■■□ 3.16
CCDC180Q9P1Z9 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.76■■■■□ 3.16
CCDC180Q9P1Z9 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.76■■■■□ 3.16
CCDC180Q9P1Z9 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC34.76■■■■□ 3.16
CCDC180Q9P1Z9 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
CCDC180Q9P1Z9 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC34.76■■■■□ 3.15
CCDC180Q9P1Z9 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC34.76■■■■□ 3.15
CCDC180Q9P1Z9 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC34.76■■■■□ 3.15
CCDC180Q9P1Z9 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC34.76■■■■□ 3.15
CCDC180Q9P1Z9 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC34.76■■■■□ 3.15
CCDC180Q9P1Z9 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC34.76■■■■□ 3.15
CCDC180Q9P1Z9 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC34.76■■■■□ 3.15
CCDC180Q9P1Z9 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
CCDC180Q9P1Z9 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC34.75■■■■□ 3.15
CCDC180Q9P1Z9 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
CCDC180Q9P1Z9 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC34.75■■■■□ 3.15
CCDC180Q9P1Z9 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC34.75■■■■□ 3.15
CCDC180Q9P1Z9 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
CCDC180Q9P1Z9 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
CCDC180Q9P1Z9 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
CCDC180Q9P1Z9 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
CCDC180Q9P1Z9 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
CCDC180Q9P1Z9 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC34.75■■■■□ 3.15
CCDC180Q9P1Z9 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC34.74■■■■□ 3.15
CCDC180Q9P1Z9 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC34.74■■■■□ 3.15
CCDC180Q9P1Z9 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC34.74■■■■□ 3.15
CCDC180Q9P1Z9 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
CCDC180Q9P1Z9 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.74■■■■□ 3.15
CCDC180Q9P1Z9 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC34.74■■■■□ 3.15
CCDC180Q9P1Z9 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC34.74■■■■□ 3.15
CCDC180Q9P1Z9 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC34.74■■■■□ 3.15
CCDC180Q9P1Z9 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC34.74■■■■□ 3.15
CCDC180Q9P1Z9 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
CCDC180Q9P1Z9 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC34.74■■■■□ 3.15
CCDC180Q9P1Z9 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC34.74■■■■□ 3.15
CCDC180Q9P1Z9 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
CCDC180Q9P1Z9 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC34.73■■■■□ 3.15
CCDC180Q9P1Z9 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC34.73■■■■□ 3.15
CCDC180Q9P1Z9 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms