Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z3

HCN3, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 3, humanhuman

Predictions only

Length 774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN3Q9P1Z3 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HCN3Q9P1Z3 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HCN3Q9P1Z3 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HCN3Q9P1Z3 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HCN3Q9P1Z3 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HCN3Q9P1Z3 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HCN3Q9P1Z3 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HCN3Q9P1Z3 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HCN3Q9P1Z3 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HCN3Q9P1Z3 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HCN3Q9P1Z3 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HCN3Q9P1Z3 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HCN3Q9P1Z3 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HCN3Q9P1Z3 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HCN3Q9P1Z3 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HCN3Q9P1Z3 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HCN3Q9P1Z3 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
HCN3Q9P1Z3 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HCN3Q9P1Z3 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HCN3Q9P1Z3 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
HCN3Q9P1Z3 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
HCN3Q9P1Z3 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HCN3Q9P1Z3 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
HCN3Q9P1Z3 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
HCN3Q9P1Z3 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HCN3Q9P1Z3 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HCN3Q9P1Z3 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HCN3Q9P1Z3 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
HCN3Q9P1Z3 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HCN3Q9P1Z3 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HCN3Q9P1Z3 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HCN3Q9P1Z3 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HCN3Q9P1Z3 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
HCN3Q9P1Z3 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HCN3Q9P1Z3 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HCN3Q9P1Z3 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HCN3Q9P1Z3 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HCN3Q9P1Z3 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HCN3Q9P1Z3 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HCN3Q9P1Z3 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HCN3Q9P1Z3 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HCN3Q9P1Z3 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HCN3Q9P1Z3 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HCN3Q9P1Z3 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
HCN3Q9P1Z3 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HCN3Q9P1Z3 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HCN3Q9P1Z3 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HCN3Q9P1Z3 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HCN3Q9P1Z3 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HCN3Q9P1Z3 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HCN3Q9P1Z3 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HCN3Q9P1Z3 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HCN3Q9P1Z3 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HCN3Q9P1Z3 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HCN3Q9P1Z3 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HCN3Q9P1Z3 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HCN3Q9P1Z3 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
HCN3Q9P1Z3 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
HCN3Q9P1Z3 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HCN3Q9P1Z3 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HCN3Q9P1Z3 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HCN3Q9P1Z3 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HCN3Q9P1Z3 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HCN3Q9P1Z3 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HCN3Q9P1Z3 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HCN3Q9P1Z3 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HCN3Q9P1Z3 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HCN3Q9P1Z3 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HCN3Q9P1Z3 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HCN3Q9P1Z3 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HCN3Q9P1Z3 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HCN3Q9P1Z3 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HCN3Q9P1Z3 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HCN3Q9P1Z3 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HCN3Q9P1Z3 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HCN3Q9P1Z3 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HCN3Q9P1Z3 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HCN3Q9P1Z3 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HCN3Q9P1Z3 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HCN3Q9P1Z3 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HCN3Q9P1Z3 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HCN3Q9P1Z3 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HCN3Q9P1Z3 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HCN3Q9P1Z3 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HCN3Q9P1Z3 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HCN3Q9P1Z3 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HCN3Q9P1Z3 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HCN3Q9P1Z3 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HCN3Q9P1Z3 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
HCN3Q9P1Z3 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
HCN3Q9P1Z3 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
HCN3Q9P1Z3 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HCN3Q9P1Z3 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
HCN3Q9P1Z3 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HCN3Q9P1Z3 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HCN3Q9P1Z3 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HCN3Q9P1Z3 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HCN3Q9P1Z3 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HCN3Q9P1Z3 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HCN3Q9P1Z3 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms