Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z2

CALCOCO1, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO1Q9P1Z2 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CALCOCO1Q9P1Z2 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CALCOCO1Q9P1Z2 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CALCOCO1Q9P1Z2 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CALCOCO1Q9P1Z2 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CALCOCO1Q9P1Z2 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CALCOCO1Q9P1Z2 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CALCOCO1Q9P1Z2 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CALCOCO1Q9P1Z2 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CALCOCO1Q9P1Z2 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CALCOCO1Q9P1Z2 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CALCOCO1Q9P1Z2 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CALCOCO1Q9P1Z2 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CALCOCO1Q9P1Z2 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CALCOCO1Q9P1Z2 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CALCOCO1Q9P1Z2 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CALCOCO1Q9P1Z2 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CALCOCO1Q9P1Z2 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CALCOCO1Q9P1Z2 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CALCOCO1Q9P1Z2 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CALCOCO1Q9P1Z2 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CALCOCO1Q9P1Z2 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CALCOCO1Q9P1Z2 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CALCOCO1Q9P1Z2 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CALCOCO1Q9P1Z2 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CALCOCO1Q9P1Z2 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CALCOCO1Q9P1Z2 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CALCOCO1Q9P1Z2 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CALCOCO1Q9P1Z2 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CALCOCO1Q9P1Z2 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CALCOCO1Q9P1Z2 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CALCOCO1Q9P1Z2 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CALCOCO1Q9P1Z2 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CALCOCO1Q9P1Z2 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CALCOCO1Q9P1Z2 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CALCOCO1Q9P1Z2 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CALCOCO1Q9P1Z2 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CALCOCO1Q9P1Z2 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CALCOCO1Q9P1Z2 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CALCOCO1Q9P1Z2 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CALCOCO1Q9P1Z2 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CALCOCO1Q9P1Z2 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CALCOCO1Q9P1Z2 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CALCOCO1Q9P1Z2 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CALCOCO1Q9P1Z2 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CALCOCO1Q9P1Z2 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CALCOCO1Q9P1Z2 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CALCOCO1Q9P1Z2 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CALCOCO1Q9P1Z2 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CALCOCO1Q9P1Z2 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CALCOCO1Q9P1Z2 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CALCOCO1Q9P1Z2 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CALCOCO1Q9P1Z2 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CALCOCO1Q9P1Z2 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CALCOCO1Q9P1Z2 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CALCOCO1Q9P1Z2 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CALCOCO1Q9P1Z2 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CALCOCO1Q9P1Z2 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CALCOCO1Q9P1Z2 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CALCOCO1Q9P1Z2 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CALCOCO1Q9P1Z2 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CALCOCO1Q9P1Z2 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CALCOCO1Q9P1Z2 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CALCOCO1Q9P1Z2 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CALCOCO1Q9P1Z2 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CALCOCO1Q9P1Z2 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CALCOCO1Q9P1Z2 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CALCOCO1Q9P1Z2 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CALCOCO1Q9P1Z2 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CALCOCO1Q9P1Z2 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CALCOCO1Q9P1Z2 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CALCOCO1Q9P1Z2 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CALCOCO1Q9P1Z2 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CALCOCO1Q9P1Z2 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CALCOCO1Q9P1Z2 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CALCOCO1Q9P1Z2 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CALCOCO1Q9P1Z2 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CALCOCO1Q9P1Z2 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CALCOCO1Q9P1Z2 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CALCOCO1Q9P1Z2 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CALCOCO1Q9P1Z2 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CALCOCO1Q9P1Z2 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CALCOCO1Q9P1Z2 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CALCOCO1Q9P1Z2 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CALCOCO1Q9P1Z2 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CALCOCO1Q9P1Z2 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CALCOCO1Q9P1Z2 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CALCOCO1Q9P1Z2 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CALCOCO1Q9P1Z2 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CALCOCO1Q9P1Z2 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CALCOCO1Q9P1Z2 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CALCOCO1Q9P1Z2 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CALCOCO1Q9P1Z2 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CALCOCO1Q9P1Z2 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CALCOCO1Q9P1Z2 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CALCOCO1Q9P1Z2 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CALCOCO1Q9P1Z2 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CALCOCO1Q9P1Z2 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CALCOCO1Q9P1Z2 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CALCOCO1Q9P1Z2 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
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