Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J7

KCMF1, E3 ubiquitin-protein ligase KCMF1, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCMF1Q9P0J7 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCMF1Q9P0J7 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCMF1Q9P0J7 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCMF1Q9P0J7 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCMF1Q9P0J7 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCMF1Q9P0J7 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCMF1Q9P0J7 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCMF1Q9P0J7 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCMF1Q9P0J7 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
KCMF1Q9P0J7 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCMF1Q9P0J7 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCMF1Q9P0J7 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCMF1Q9P0J7 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCMF1Q9P0J7 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCMF1Q9P0J7 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCMF1Q9P0J7 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCMF1Q9P0J7 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCMF1Q9P0J7 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCMF1Q9P0J7 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
KCMF1Q9P0J7 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCMF1Q9P0J7 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCMF1Q9P0J7 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCMF1Q9P0J7 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCMF1Q9P0J7 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCMF1Q9P0J7 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCMF1Q9P0J7 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCMF1Q9P0J7 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCMF1Q9P0J7 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
KCMF1Q9P0J7 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCMF1Q9P0J7 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCMF1Q9P0J7 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCMF1Q9P0J7 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
KCMF1Q9P0J7 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCMF1Q9P0J7 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCMF1Q9P0J7 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCMF1Q9P0J7 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCMF1Q9P0J7 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
KCMF1Q9P0J7 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCMF1Q9P0J7 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCMF1Q9P0J7 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
KCMF1Q9P0J7 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
KCMF1Q9P0J7 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCMF1Q9P0J7 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCMF1Q9P0J7 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCMF1Q9P0J7 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
KCMF1Q9P0J7 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCMF1Q9P0J7 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCMF1Q9P0J7 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCMF1Q9P0J7 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCMF1Q9P0J7 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCMF1Q9P0J7 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCMF1Q9P0J7 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCMF1Q9P0J7 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCMF1Q9P0J7 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCMF1Q9P0J7 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCMF1Q9P0J7 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCMF1Q9P0J7 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCMF1Q9P0J7 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCMF1Q9P0J7 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCMF1Q9P0J7 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCMF1Q9P0J7 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCMF1Q9P0J7 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCMF1Q9P0J7 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCMF1Q9P0J7 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCMF1Q9P0J7 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCMF1Q9P0J7 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCMF1Q9P0J7 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCMF1Q9P0J7 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCMF1Q9P0J7 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCMF1Q9P0J7 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCMF1Q9P0J7 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCMF1Q9P0J7 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCMF1Q9P0J7 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCMF1Q9P0J7 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
KCMF1Q9P0J7 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCMF1Q9P0J7 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCMF1Q9P0J7 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCMF1Q9P0J7 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCMF1Q9P0J7 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCMF1Q9P0J7 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCMF1Q9P0J7 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCMF1Q9P0J7 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCMF1Q9P0J7 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCMF1Q9P0J7 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCMF1Q9P0J7 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCMF1Q9P0J7 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCMF1Q9P0J7 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCMF1Q9P0J7 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCMF1Q9P0J7 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCMF1Q9P0J7 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCMF1Q9P0J7 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCMF1Q9P0J7 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCMF1Q9P0J7 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCMF1Q9P0J7 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCMF1Q9P0J7 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCMF1Q9P0J7 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCMF1Q9P0J7 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCMF1Q9P0J7 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCMF1Q9P0J7 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCMF1Q9P0J7 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms