Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ40

SLC52A3, Solute carrier family 52, riboflavin transporter, member 3, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC52A3Q9NQ40 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC52A3Q9NQ40 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC52A3Q9NQ40 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC52A3Q9NQ40 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC52A3Q9NQ40 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC52A3Q9NQ40 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC52A3Q9NQ40 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC52A3Q9NQ40 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC52A3Q9NQ40 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC52A3Q9NQ40 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC52A3Q9NQ40 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC52A3Q9NQ40 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC52A3Q9NQ40 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC52A3Q9NQ40 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC52A3Q9NQ40 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC52A3Q9NQ40 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC52A3Q9NQ40 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC52A3Q9NQ40 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC52A3Q9NQ40 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC52A3Q9NQ40 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC52A3Q9NQ40 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC52A3Q9NQ40 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC52A3Q9NQ40 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC52A3Q9NQ40 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC52A3Q9NQ40 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC52A3Q9NQ40 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC52A3Q9NQ40 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC52A3Q9NQ40 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC52A3Q9NQ40 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC52A3Q9NQ40 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC52A3Q9NQ40 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC52A3Q9NQ40 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC52A3Q9NQ40 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC52A3Q9NQ40 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC52A3Q9NQ40 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC52A3Q9NQ40 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC52A3Q9NQ40 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC52A3Q9NQ40 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC52A3Q9NQ40 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC52A3Q9NQ40 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC52A3Q9NQ40 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC52A3Q9NQ40 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC52A3Q9NQ40 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC52A3Q9NQ40 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC52A3Q9NQ40 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC52A3Q9NQ40 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC52A3Q9NQ40 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC52A3Q9NQ40 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC52A3Q9NQ40 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC52A3Q9NQ40 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC52A3Q9NQ40 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC52A3Q9NQ40 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC52A3Q9NQ40 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC52A3Q9NQ40 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC52A3Q9NQ40 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC52A3Q9NQ40 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC52A3Q9NQ40 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC52A3Q9NQ40 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC52A3Q9NQ40 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC52A3Q9NQ40 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC52A3Q9NQ40 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC52A3Q9NQ40 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC52A3Q9NQ40 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC52A3Q9NQ40 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC52A3Q9NQ40 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC52A3Q9NQ40 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC52A3Q9NQ40 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC52A3Q9NQ40 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC52A3Q9NQ40 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC52A3Q9NQ40 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC52A3Q9NQ40 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC52A3Q9NQ40 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC52A3Q9NQ40 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC52A3Q9NQ40 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC52A3Q9NQ40 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC52A3Q9NQ40 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC52A3Q9NQ40 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC52A3Q9NQ40 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC52A3Q9NQ40 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC52A3Q9NQ40 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC52A3Q9NQ40 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC52A3Q9NQ40 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC52A3Q9NQ40 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC52A3Q9NQ40 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC52A3Q9NQ40 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC52A3Q9NQ40 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC52A3Q9NQ40 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC52A3Q9NQ40 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC52A3Q9NQ40 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC52A3Q9NQ40 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC52A3Q9NQ40 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC52A3Q9NQ40 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC52A3Q9NQ40 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC52A3Q9NQ40 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC52A3Q9NQ40 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC52A3Q9NQ40 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC52A3Q9NQ40 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC52A3Q9NQ40 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC52A3Q9NQ40 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC52A3Q9NQ40 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.7 ms