Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2C1

LHX5, LIM/homeobox protein Lhx5, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX5Q9H2C1 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LHX5Q9H2C1 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LHX5Q9H2C1 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
LHX5Q9H2C1 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LHX5Q9H2C1 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LHX5Q9H2C1 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LHX5Q9H2C1 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LHX5Q9H2C1 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
LHX5Q9H2C1 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LHX5Q9H2C1 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LHX5Q9H2C1 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LHX5Q9H2C1 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LHX5Q9H2C1 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LHX5Q9H2C1 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LHX5Q9H2C1 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LHX5Q9H2C1 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LHX5Q9H2C1 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LHX5Q9H2C1 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LHX5Q9H2C1 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LHX5Q9H2C1 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LHX5Q9H2C1 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LHX5Q9H2C1 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LHX5Q9H2C1 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LHX5Q9H2C1 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LHX5Q9H2C1 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LHX5Q9H2C1 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LHX5Q9H2C1 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LHX5Q9H2C1 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LHX5Q9H2C1 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LHX5Q9H2C1 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
LHX5Q9H2C1 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
LHX5Q9H2C1 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LHX5Q9H2C1 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LHX5Q9H2C1 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LHX5Q9H2C1 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LHX5Q9H2C1 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LHX5Q9H2C1 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LHX5Q9H2C1 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LHX5Q9H2C1 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LHX5Q9H2C1 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LHX5Q9H2C1 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LHX5Q9H2C1 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LHX5Q9H2C1 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LHX5Q9H2C1 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
LHX5Q9H2C1 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LHX5Q9H2C1 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LHX5Q9H2C1 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
LHX5Q9H2C1 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LHX5Q9H2C1 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LHX5Q9H2C1 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LHX5Q9H2C1 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LHX5Q9H2C1 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LHX5Q9H2C1 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LHX5Q9H2C1 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LHX5Q9H2C1 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
LHX5Q9H2C1 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LHX5Q9H2C1 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LHX5Q9H2C1 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LHX5Q9H2C1 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LHX5Q9H2C1 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LHX5Q9H2C1 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LHX5Q9H2C1 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
LHX5Q9H2C1 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LHX5Q9H2C1 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LHX5Q9H2C1 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LHX5Q9H2C1 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LHX5Q9H2C1 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LHX5Q9H2C1 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LHX5Q9H2C1 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LHX5Q9H2C1 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LHX5Q9H2C1 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LHX5Q9H2C1 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LHX5Q9H2C1 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LHX5Q9H2C1 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LHX5Q9H2C1 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LHX5Q9H2C1 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LHX5Q9H2C1 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LHX5Q9H2C1 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
LHX5Q9H2C1 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LHX5Q9H2C1 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LHX5Q9H2C1 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LHX5Q9H2C1 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LHX5Q9H2C1 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LHX5Q9H2C1 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LHX5Q9H2C1 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LHX5Q9H2C1 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LHX5Q9H2C1 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LHX5Q9H2C1 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LHX5Q9H2C1 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LHX5Q9H2C1 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LHX5Q9H2C1 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LHX5Q9H2C1 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LHX5Q9H2C1 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LHX5Q9H2C1 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LHX5Q9H2C1 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
LHX5Q9H2C1 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
LHX5Q9H2C1 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
LHX5Q9H2C1 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
LHX5Q9H2C1 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LHX5Q9H2C1 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms