Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0U4

RAB1B, Ras-related protein Rab-1B, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB1BQ9H0U4 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB1BQ9H0U4 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB1BQ9H0U4 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB1BQ9H0U4 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB1BQ9H0U4 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB1BQ9H0U4 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB1BQ9H0U4 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB1BQ9H0U4 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB1BQ9H0U4 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB1BQ9H0U4 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB1BQ9H0U4 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB1BQ9H0U4 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB1BQ9H0U4 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB1BQ9H0U4 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB1BQ9H0U4 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB1BQ9H0U4 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB1BQ9H0U4 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB1BQ9H0U4 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB1BQ9H0U4 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB1BQ9H0U4 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB1BQ9H0U4 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB1BQ9H0U4 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB1BQ9H0U4 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB1BQ9H0U4 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB1BQ9H0U4 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB1BQ9H0U4 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB1BQ9H0U4 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB1BQ9H0U4 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB1BQ9H0U4 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB1BQ9H0U4 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB1BQ9H0U4 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB1BQ9H0U4 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB1BQ9H0U4 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB1BQ9H0U4 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB1BQ9H0U4 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB1BQ9H0U4 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB1BQ9H0U4 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB1BQ9H0U4 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB1BQ9H0U4 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB1BQ9H0U4 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB1BQ9H0U4 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB1BQ9H0U4 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB1BQ9H0U4 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB1BQ9H0U4 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB1BQ9H0U4 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB1BQ9H0U4 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB1BQ9H0U4 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB1BQ9H0U4 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB1BQ9H0U4 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB1BQ9H0U4 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB1BQ9H0U4 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB1BQ9H0U4 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB1BQ9H0U4 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB1BQ9H0U4 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB1BQ9H0U4 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB1BQ9H0U4 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB1BQ9H0U4 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB1BQ9H0U4 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB1BQ9H0U4 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB1BQ9H0U4 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB1BQ9H0U4 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB1BQ9H0U4 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB1BQ9H0U4 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB1BQ9H0U4 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB1BQ9H0U4 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB1BQ9H0U4 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB1BQ9H0U4 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB1BQ9H0U4 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB1BQ9H0U4 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB1BQ9H0U4 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB1BQ9H0U4 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB1BQ9H0U4 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB1BQ9H0U4 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB1BQ9H0U4 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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RAB1BQ9H0U4 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB1BQ9H0U4 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB1BQ9H0U4 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB1BQ9H0U4 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB1BQ9H0U4 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB1BQ9H0U4 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB1BQ9H0U4 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB1BQ9H0U4 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB1BQ9H0U4 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB1BQ9H0U4 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB1BQ9H0U4 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB1BQ9H0U4 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB1BQ9H0U4 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB1BQ9H0U4 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB1BQ9H0U4 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB1BQ9H0U4 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB1BQ9H0U4 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB1BQ9H0U4 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB1BQ9H0U4 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB1BQ9H0U4 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB1BQ9H0U4 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB1BQ9H0U4 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB1BQ9H0U4 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB1BQ9H0U4 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB1BQ9H0U4 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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