Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXE9

VN1R3, Vomeronasal type-1 receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VN1R3Q9BXE9 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
VN1R3Q9BXE9 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VN1R3Q9BXE9 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VN1R3Q9BXE9 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
VN1R3Q9BXE9 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
VN1R3Q9BXE9 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
VN1R3Q9BXE9 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
VN1R3Q9BXE9 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VN1R3Q9BXE9 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
VN1R3Q9BXE9 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
VN1R3Q9BXE9 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.5
VN1R3Q9BXE9 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
VN1R3Q9BXE9 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
VN1R3Q9BXE9 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
VN1R3Q9BXE9 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
VN1R3Q9BXE9 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
VN1R3Q9BXE9 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
VN1R3Q9BXE9 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
VN1R3Q9BXE9 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
VN1R3Q9BXE9 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
VN1R3Q9BXE9 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
VN1R3Q9BXE9 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
VN1R3Q9BXE9 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
VN1R3Q9BXE9 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
VN1R3Q9BXE9 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
VN1R3Q9BXE9 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
VN1R3Q9BXE9 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
VN1R3Q9BXE9 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
VN1R3Q9BXE9 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
VN1R3Q9BXE9 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
VN1R3Q9BXE9 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
VN1R3Q9BXE9 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
VN1R3Q9BXE9 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
VN1R3Q9BXE9 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
VN1R3Q9BXE9 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
VN1R3Q9BXE9 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
VN1R3Q9BXE9 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
VN1R3Q9BXE9 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
VN1R3Q9BXE9 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
VN1R3Q9BXE9 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VN1R3Q9BXE9 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VN1R3Q9BXE9 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VN1R3Q9BXE9 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
VN1R3Q9BXE9 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
VN1R3Q9BXE9 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VN1R3Q9BXE9 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
VN1R3Q9BXE9 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
VN1R3Q9BXE9 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VN1R3Q9BXE9 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VN1R3Q9BXE9 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VN1R3Q9BXE9 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
VN1R3Q9BXE9 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
VN1R3Q9BXE9 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
VN1R3Q9BXE9 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
VN1R3Q9BXE9 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
VN1R3Q9BXE9 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VN1R3Q9BXE9 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
VN1R3Q9BXE9 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
VN1R3Q9BXE9 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
VN1R3Q9BXE9 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
VN1R3Q9BXE9 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
VN1R3Q9BXE9 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
VN1R3Q9BXE9 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
VN1R3Q9BXE9 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VN1R3Q9BXE9 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
VN1R3Q9BXE9 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VN1R3Q9BXE9 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VN1R3Q9BXE9 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VN1R3Q9BXE9 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
VN1R3Q9BXE9 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
VN1R3Q9BXE9 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VN1R3Q9BXE9 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
VN1R3Q9BXE9 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
VN1R3Q9BXE9 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VN1R3Q9BXE9 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
VN1R3Q9BXE9 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
VN1R3Q9BXE9 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
VN1R3Q9BXE9 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
VN1R3Q9BXE9 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VN1R3Q9BXE9 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VN1R3Q9BXE9 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VN1R3Q9BXE9 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VN1R3Q9BXE9 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VN1R3Q9BXE9 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VN1R3Q9BXE9 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VN1R3Q9BXE9 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
VN1R3Q9BXE9 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
VN1R3Q9BXE9 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
VN1R3Q9BXE9 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
VN1R3Q9BXE9 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
VN1R3Q9BXE9 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VN1R3Q9BXE9 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
VN1R3Q9BXE9 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
VN1R3Q9BXE9 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
VN1R3Q9BXE9 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
VN1R3Q9BXE9 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
VN1R3Q9BXE9 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
VN1R3Q9BXE9 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VN1R3Q9BXE9 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VN1R3Q9BXE9 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms