Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI6

SLF1, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,058 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLF1Q9BQI6 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLF1Q9BQI6 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLF1Q9BQI6 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLF1Q9BQI6 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SLF1Q9BQI6 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SLF1Q9BQI6 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLF1Q9BQI6 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLF1Q9BQI6 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLF1Q9BQI6 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLF1Q9BQI6 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLF1Q9BQI6 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLF1Q9BQI6 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLF1Q9BQI6 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLF1Q9BQI6 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLF1Q9BQI6 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLF1Q9BQI6 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLF1Q9BQI6 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SLF1Q9BQI6 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLF1Q9BQI6 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLF1Q9BQI6 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLF1Q9BQI6 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLF1Q9BQI6 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLF1Q9BQI6 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLF1Q9BQI6 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLF1Q9BQI6 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLF1Q9BQI6 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLF1Q9BQI6 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLF1Q9BQI6 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLF1Q9BQI6 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLF1Q9BQI6 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLF1Q9BQI6 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLF1Q9BQI6 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLF1Q9BQI6 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLF1Q9BQI6 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLF1Q9BQI6 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLF1Q9BQI6 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLF1Q9BQI6 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLF1Q9BQI6 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLF1Q9BQI6 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLF1Q9BQI6 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SLF1Q9BQI6 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLF1Q9BQI6 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLF1Q9BQI6 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLF1Q9BQI6 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLF1Q9BQI6 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLF1Q9BQI6 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLF1Q9BQI6 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SLF1Q9BQI6 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLF1Q9BQI6 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLF1Q9BQI6 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLF1Q9BQI6 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SLF1Q9BQI6 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLF1Q9BQI6 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLF1Q9BQI6 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLF1Q9BQI6 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLF1Q9BQI6 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLF1Q9BQI6 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLF1Q9BQI6 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLF1Q9BQI6 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLF1Q9BQI6 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLF1Q9BQI6 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SLF1Q9BQI6 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLF1Q9BQI6 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLF1Q9BQI6 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLF1Q9BQI6 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLF1Q9BQI6 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLF1Q9BQI6 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLF1Q9BQI6 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLF1Q9BQI6 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLF1Q9BQI6 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLF1Q9BQI6 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLF1Q9BQI6 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLF1Q9BQI6 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLF1Q9BQI6 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLF1Q9BQI6 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLF1Q9BQI6 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLF1Q9BQI6 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLF1Q9BQI6 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLF1Q9BQI6 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLF1Q9BQI6 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLF1Q9BQI6 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLF1Q9BQI6 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLF1Q9BQI6 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLF1Q9BQI6 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLF1Q9BQI6 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLF1Q9BQI6 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLF1Q9BQI6 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLF1Q9BQI6 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLF1Q9BQI6 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLF1Q9BQI6 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SLF1Q9BQI6 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLF1Q9BQI6 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLF1Q9BQI6 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLF1Q9BQI6 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SLF1Q9BQI6 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLF1Q9BQI6 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SLF1Q9BQI6 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLF1Q9BQI6 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLF1Q9BQI6 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLF1Q9BQI6 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms