Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQA5

HINFP, Histone H4 transcription factor, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HINFPQ9BQA5 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
HINFPQ9BQA5 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
HINFPQ9BQA5 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
HINFPQ9BQA5 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
HINFPQ9BQA5 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
HINFPQ9BQA5 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC18.81■□□□□ 0.6
HINFPQ9BQA5 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
HINFPQ9BQA5 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
HINFPQ9BQA5 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
HINFPQ9BQA5 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
HINFPQ9BQA5 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
HINFPQ9BQA5 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
HINFPQ9BQA5 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
HINFPQ9BQA5 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
HINFPQ9BQA5 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HINFPQ9BQA5 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HINFPQ9BQA5 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
HINFPQ9BQA5 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
HINFPQ9BQA5 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HINFPQ9BQA5 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
HINFPQ9BQA5 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
HINFPQ9BQA5 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HINFPQ9BQA5 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HINFPQ9BQA5 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HINFPQ9BQA5 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HINFPQ9BQA5 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HINFPQ9BQA5 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HINFPQ9BQA5 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HINFPQ9BQA5 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
HINFPQ9BQA5 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
HINFPQ9BQA5 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
HINFPQ9BQA5 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
HINFPQ9BQA5 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HINFPQ9BQA5 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
HINFPQ9BQA5 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HINFPQ9BQA5 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
HINFPQ9BQA5 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HINFPQ9BQA5 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
HINFPQ9BQA5 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HINFPQ9BQA5 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HINFPQ9BQA5 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
HINFPQ9BQA5 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
HINFPQ9BQA5 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HINFPQ9BQA5 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HINFPQ9BQA5 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
HINFPQ9BQA5 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HINFPQ9BQA5 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HINFPQ9BQA5 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.8■□□□□ 0.6
HINFPQ9BQA5 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HINFPQ9BQA5 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
HINFPQ9BQA5 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HINFPQ9BQA5 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HINFPQ9BQA5 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
HINFPQ9BQA5 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HINFPQ9BQA5 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HINFPQ9BQA5 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HINFPQ9BQA5 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HINFPQ9BQA5 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HINFPQ9BQA5 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HINFPQ9BQA5 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HINFPQ9BQA5 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HINFPQ9BQA5 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HINFPQ9BQA5 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HINFPQ9BQA5 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HINFPQ9BQA5 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HINFPQ9BQA5 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HINFPQ9BQA5 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HINFPQ9BQA5 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HINFPQ9BQA5 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HINFPQ9BQA5 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HINFPQ9BQA5 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
HINFPQ9BQA5 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HINFPQ9BQA5 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
HINFPQ9BQA5 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HINFPQ9BQA5 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HINFPQ9BQA5 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HINFPQ9BQA5 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HINFPQ9BQA5 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HINFPQ9BQA5 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HINFPQ9BQA5 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HINFPQ9BQA5 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HINFPQ9BQA5 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HINFPQ9BQA5 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HINFPQ9BQA5 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HINFPQ9BQA5 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HINFPQ9BQA5 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HINFPQ9BQA5 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HINFPQ9BQA5 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HINFPQ9BQA5 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HINFPQ9BQA5 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HINFPQ9BQA5 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HINFPQ9BQA5 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
HINFPQ9BQA5 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HINFPQ9BQA5 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HINFPQ9BQA5 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HINFPQ9BQA5 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HINFPQ9BQA5 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HINFPQ9BQA5 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HINFPQ9BQA5 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
HINFPQ9BQA5 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms