Protein–RNA interactions for Protein: Q99795

GPA33, Cell surface A33 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPA33Q99795 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPA33Q99795 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPA33Q99795 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPA33Q99795 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPA33Q99795 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPA33Q99795 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPA33Q99795 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GPA33Q99795 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPA33Q99795 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPA33Q99795 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPA33Q99795 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPA33Q99795 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPA33Q99795 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPA33Q99795 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPA33Q99795 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPA33Q99795 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPA33Q99795 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPA33Q99795 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPA33Q99795 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPA33Q99795 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPA33Q99795 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPA33Q99795 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GPA33Q99795 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPA33Q99795 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GPA33Q99795 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPA33Q99795 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPA33Q99795 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPA33Q99795 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GPA33Q99795 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GPA33Q99795 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPA33Q99795 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPA33Q99795 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPA33Q99795 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPA33Q99795 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPA33Q99795 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPA33Q99795 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPA33Q99795 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPA33Q99795 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPA33Q99795 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPA33Q99795 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPA33Q99795 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPA33Q99795 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPA33Q99795 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPA33Q99795 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPA33Q99795 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPA33Q99795 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPA33Q99795 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPA33Q99795 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPA33Q99795 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GPA33Q99795 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GPA33Q99795 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GPA33Q99795 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GPA33Q99795 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GPA33Q99795 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GPA33Q99795 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GPA33Q99795 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GPA33Q99795 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GPA33Q99795 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GPA33Q99795 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GPA33Q99795 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GPA33Q99795 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GPA33Q99795 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GPA33Q99795 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GPA33Q99795 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GPA33Q99795 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
GPA33Q99795 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GPA33Q99795 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
GPA33Q99795 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
GPA33Q99795 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GPA33Q99795 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GPA33Q99795 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GPA33Q99795 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GPA33Q99795 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GPA33Q99795 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GPA33Q99795 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GPA33Q99795 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GPA33Q99795 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GPA33Q99795 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GPA33Q99795 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GPA33Q99795 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GPA33Q99795 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GPA33Q99795 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GPA33Q99795 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GPA33Q99795 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
GPA33Q99795 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GPA33Q99795 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GPA33Q99795 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GPA33Q99795 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GPA33Q99795 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GPA33Q99795 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GPA33Q99795 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GPA33Q99795 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GPA33Q99795 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GPA33Q99795 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GPA33Q99795 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GPA33Q99795 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GPA33Q99795 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GPA33Q99795 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GPA33Q99795 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GPA33Q99795 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms