Protein–RNA interactions for Protein: Q99742

NPAS1, Neuronal PAS domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPAS1Q99742 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NPAS1Q99742 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NPAS1Q99742 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NPAS1Q99742 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NPAS1Q99742 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NPAS1Q99742 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NPAS1Q99742 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
NPAS1Q99742 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NPAS1Q99742 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NPAS1Q99742 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
NPAS1Q99742 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NPAS1Q99742 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NPAS1Q99742 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NPAS1Q99742 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NPAS1Q99742 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NPAS1Q99742 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
NPAS1Q99742 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NPAS1Q99742 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NPAS1Q99742 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NPAS1Q99742 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NPAS1Q99742 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NPAS1Q99742 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NPAS1Q99742 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NPAS1Q99742 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NPAS1Q99742 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NPAS1Q99742 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NPAS1Q99742 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NPAS1Q99742 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NPAS1Q99742 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NPAS1Q99742 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NPAS1Q99742 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NPAS1Q99742 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NPAS1Q99742 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NPAS1Q99742 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NPAS1Q99742 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NPAS1Q99742 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NPAS1Q99742 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NPAS1Q99742 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NPAS1Q99742 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NPAS1Q99742 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NPAS1Q99742 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NPAS1Q99742 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NPAS1Q99742 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NPAS1Q99742 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NPAS1Q99742 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NPAS1Q99742 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NPAS1Q99742 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NPAS1Q99742 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NPAS1Q99742 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NPAS1Q99742 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NPAS1Q99742 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NPAS1Q99742 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NPAS1Q99742 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NPAS1Q99742 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
NPAS1Q99742 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
NPAS1Q99742 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
NPAS1Q99742 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
NPAS1Q99742 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NPAS1Q99742 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NPAS1Q99742 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NPAS1Q99742 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NPAS1Q99742 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NPAS1Q99742 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NPAS1Q99742 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NPAS1Q99742 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NPAS1Q99742 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NPAS1Q99742 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NPAS1Q99742 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NPAS1Q99742 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NPAS1Q99742 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NPAS1Q99742 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NPAS1Q99742 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NPAS1Q99742 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NPAS1Q99742 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NPAS1Q99742 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NPAS1Q99742 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NPAS1Q99742 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NPAS1Q99742 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NPAS1Q99742 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NPAS1Q99742 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
NPAS1Q99742 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NPAS1Q99742 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
NPAS1Q99742 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NPAS1Q99742 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
NPAS1Q99742 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NPAS1Q99742 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NPAS1Q99742 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
NPAS1Q99742 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NPAS1Q99742 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
NPAS1Q99742 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NPAS1Q99742 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NPAS1Q99742 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NPAS1Q99742 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NPAS1Q99742 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NPAS1Q99742 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
NPAS1Q99742 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NPAS1Q99742 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NPAS1Q99742 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NPAS1Q99742 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NPAS1Q99742 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.7 ms