Protein–RNA interactions for Protein: Q99612

KLF6, Krueppel-like factor 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF6Q99612 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLF6Q99612 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLF6Q99612 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLF6Q99612 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLF6Q99612 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLF6Q99612 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLF6Q99612 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
KLF6Q99612 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLF6Q99612 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLF6Q99612 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLF6Q99612 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLF6Q99612 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLF6Q99612 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLF6Q99612 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLF6Q99612 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLF6Q99612 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLF6Q99612 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLF6Q99612 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLF6Q99612 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLF6Q99612 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLF6Q99612 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLF6Q99612 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLF6Q99612 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLF6Q99612 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLF6Q99612 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLF6Q99612 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLF6Q99612 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLF6Q99612 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLF6Q99612 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KLF6Q99612 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KLF6Q99612 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KLF6Q99612 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KLF6Q99612 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KLF6Q99612 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KLF6Q99612 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KLF6Q99612 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KLF6Q99612 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KLF6Q99612 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KLF6Q99612 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KLF6Q99612 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KLF6Q99612 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KLF6Q99612 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KLF6Q99612 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KLF6Q99612 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
KLF6Q99612 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KLF6Q99612 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
KLF6Q99612 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KLF6Q99612 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KLF6Q99612 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KLF6Q99612 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KLF6Q99612 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KLF6Q99612 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KLF6Q99612 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KLF6Q99612 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KLF6Q99612 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KLF6Q99612 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KLF6Q99612 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KLF6Q99612 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KLF6Q99612 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KLF6Q99612 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KLF6Q99612 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KLF6Q99612 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KLF6Q99612 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KLF6Q99612 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KLF6Q99612 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLF6Q99612 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLF6Q99612 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLF6Q99612 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLF6Q99612 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLF6Q99612 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLF6Q99612 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLF6Q99612 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLF6Q99612 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLF6Q99612 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
KLF6Q99612 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLF6Q99612 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLF6Q99612 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLF6Q99612 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLF6Q99612 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLF6Q99612 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
KLF6Q99612 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLF6Q99612 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
KLF6Q99612 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLF6Q99612 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLF6Q99612 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLF6Q99612 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLF6Q99612 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLF6Q99612 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLF6Q99612 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLF6Q99612 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLF6Q99612 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLF6Q99612 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLF6Q99612 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLF6Q99612 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLF6Q99612 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLF6Q99612 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLF6Q99612 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLF6Q99612 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLF6Q99612 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLF6Q99612 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms