Protein–RNA interactions for Protein: Q99538

LGMN, Legumain, humanhuman

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGMNQ99538 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LGMNQ99538 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
LGMNQ99538 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LGMNQ99538 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LGMNQ99538 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LGMNQ99538 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LGMNQ99538 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LGMNQ99538 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
LGMNQ99538 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LGMNQ99538 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LGMNQ99538 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
LGMNQ99538 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LGMNQ99538 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LGMNQ99538 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LGMNQ99538 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LGMNQ99538 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LGMNQ99538 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LGMNQ99538 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LGMNQ99538 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
LGMNQ99538 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LGMNQ99538 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LGMNQ99538 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LGMNQ99538 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LGMNQ99538 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LGMNQ99538 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LGMNQ99538 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LGMNQ99538 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LGMNQ99538 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LGMNQ99538 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LGMNQ99538 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LGMNQ99538 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LGMNQ99538 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LGMNQ99538 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LGMNQ99538 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
LGMNQ99538 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
LGMNQ99538 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
LGMNQ99538 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
LGMNQ99538 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
LGMNQ99538 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
LGMNQ99538 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
LGMNQ99538 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
LGMNQ99538 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
LGMNQ99538 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
LGMNQ99538 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
LGMNQ99538 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LGMNQ99538 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LGMNQ99538 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LGMNQ99538 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LGMNQ99538 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LGMNQ99538 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LGMNQ99538 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
LGMNQ99538 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LGMNQ99538 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LGMNQ99538 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
LGMNQ99538 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LGMNQ99538 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LGMNQ99538 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LGMNQ99538 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LGMNQ99538 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LGMNQ99538 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LGMNQ99538 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LGMNQ99538 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LGMNQ99538 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LGMNQ99538 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LGMNQ99538 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LGMNQ99538 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LGMNQ99538 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LGMNQ99538 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LGMNQ99538 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LGMNQ99538 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LGMNQ99538 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LGMNQ99538 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LGMNQ99538 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LGMNQ99538 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LGMNQ99538 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LGMNQ99538 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LGMNQ99538 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LGMNQ99538 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LGMNQ99538 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LGMNQ99538 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LGMNQ99538 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LGMNQ99538 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LGMNQ99538 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LGMNQ99538 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LGMNQ99538 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LGMNQ99538 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LGMNQ99538 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
LGMNQ99538 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LGMNQ99538 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
LGMNQ99538 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LGMNQ99538 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LGMNQ99538 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
LGMNQ99538 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LGMNQ99538 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LGMNQ99538 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LGMNQ99538 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
LGMNQ99538 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LGMNQ99538 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LGMNQ99538 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LGMNQ99538 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms