Protein–RNA interactions for Protein: Q99062

CSF3R, Granulocyte colony-stimulating factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 836 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF3RQ99062 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CSF3RQ99062 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CSF3RQ99062 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CSF3RQ99062 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CSF3RQ99062 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CSF3RQ99062 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CSF3RQ99062 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CSF3RQ99062 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CSF3RQ99062 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CSF3RQ99062 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CSF3RQ99062 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CSF3RQ99062 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CSF3RQ99062 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CSF3RQ99062 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CSF3RQ99062 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CSF3RQ99062 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CSF3RQ99062 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CSF3RQ99062 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CSF3RQ99062 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CSF3RQ99062 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CSF3RQ99062 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CSF3RQ99062 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CSF3RQ99062 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CSF3RQ99062 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CSF3RQ99062 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CSF3RQ99062 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CSF3RQ99062 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CSF3RQ99062 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CSF3RQ99062 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CSF3RQ99062 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CSF3RQ99062 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CSF3RQ99062 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CSF3RQ99062 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CSF3RQ99062 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CSF3RQ99062 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CSF3RQ99062 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CSF3RQ99062 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CSF3RQ99062 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CSF3RQ99062 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CSF3RQ99062 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CSF3RQ99062 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CSF3RQ99062 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CSF3RQ99062 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CSF3RQ99062 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CSF3RQ99062 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CSF3RQ99062 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CSF3RQ99062 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CSF3RQ99062 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CSF3RQ99062 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CSF3RQ99062 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CSF3RQ99062 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CSF3RQ99062 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CSF3RQ99062 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSF3RQ99062 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CSF3RQ99062 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSF3RQ99062 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSF3RQ99062 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSF3RQ99062 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSF3RQ99062 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSF3RQ99062 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSF3RQ99062 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSF3RQ99062 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSF3RQ99062 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSF3RQ99062 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSF3RQ99062 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSF3RQ99062 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSF3RQ99062 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSF3RQ99062 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSF3RQ99062 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSF3RQ99062 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSF3RQ99062 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSF3RQ99062 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSF3RQ99062 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSF3RQ99062 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSF3RQ99062 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSF3RQ99062 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSF3RQ99062 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSF3RQ99062 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSF3RQ99062 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CSF3RQ99062 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSF3RQ99062 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CSF3RQ99062 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CSF3RQ99062 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSF3RQ99062 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CSF3RQ99062 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSF3RQ99062 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSF3RQ99062 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSF3RQ99062 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSF3RQ99062 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSF3RQ99062 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSF3RQ99062 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSF3RQ99062 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSF3RQ99062 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSF3RQ99062 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSF3RQ99062 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSF3RQ99062 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSF3RQ99062 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSF3RQ99062 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSF3RQ99062 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSF3RQ99062 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms