Protein–RNA interactions for Protein: Q96P64

AGAP4, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP4Q96P64 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AGAP4Q96P64 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
AGAP4Q96P64 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
AGAP4Q96P64 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
AGAP4Q96P64 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AGAP4Q96P64 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
AGAP4Q96P64 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AGAP4Q96P64 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AGAP4Q96P64 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AGAP4Q96P64 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AGAP4Q96P64 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AGAP4Q96P64 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
AGAP4Q96P64 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AGAP4Q96P64 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AGAP4Q96P64 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
AGAP4Q96P64 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AGAP4Q96P64 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AGAP4Q96P64 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
AGAP4Q96P64 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
AGAP4Q96P64 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
AGAP4Q96P64 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AGAP4Q96P64 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AGAP4Q96P64 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AGAP4Q96P64 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AGAP4Q96P64 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AGAP4Q96P64 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AGAP4Q96P64 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AGAP4Q96P64 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AGAP4Q96P64 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AGAP4Q96P64 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AGAP4Q96P64 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AGAP4Q96P64 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AGAP4Q96P64 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AGAP4Q96P64 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AGAP4Q96P64 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AGAP4Q96P64 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AGAP4Q96P64 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
AGAP4Q96P64 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
AGAP4Q96P64 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
AGAP4Q96P64 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AGAP4Q96P64 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AGAP4Q96P64 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AGAP4Q96P64 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AGAP4Q96P64 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AGAP4Q96P64 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AGAP4Q96P64 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AGAP4Q96P64 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AGAP4Q96P64 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AGAP4Q96P64 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AGAP4Q96P64 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AGAP4Q96P64 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AGAP4Q96P64 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AGAP4Q96P64 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AGAP4Q96P64 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AGAP4Q96P64 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AGAP4Q96P64 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AGAP4Q96P64 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
AGAP4Q96P64 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AGAP4Q96P64 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AGAP4Q96P64 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AGAP4Q96P64 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AGAP4Q96P64 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AGAP4Q96P64 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AGAP4Q96P64 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AGAP4Q96P64 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AGAP4Q96P64 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AGAP4Q96P64 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AGAP4Q96P64 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AGAP4Q96P64 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AGAP4Q96P64 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AGAP4Q96P64 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AGAP4Q96P64 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AGAP4Q96P64 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AGAP4Q96P64 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AGAP4Q96P64 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AGAP4Q96P64 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AGAP4Q96P64 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AGAP4Q96P64 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AGAP4Q96P64 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
AGAP4Q96P64 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AGAP4Q96P64 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AGAP4Q96P64 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AGAP4Q96P64 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AGAP4Q96P64 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AGAP4Q96P64 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AGAP4Q96P64 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AGAP4Q96P64 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AGAP4Q96P64 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AGAP4Q96P64 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AGAP4Q96P64 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AGAP4Q96P64 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AGAP4Q96P64 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AGAP4Q96P64 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AGAP4Q96P64 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AGAP4Q96P64 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AGAP4Q96P64 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AGAP4Q96P64 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AGAP4Q96P64 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AGAP4Q96P64 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AGAP4Q96P64 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.9 ms