Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM3

CHAMP1, Chromosome alignment-maintaining phosphoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAMP1Q96JM3 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHAMP1Q96JM3 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHAMP1Q96JM3 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHAMP1Q96JM3 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHAMP1Q96JM3 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHAMP1Q96JM3 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHAMP1Q96JM3 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHAMP1Q96JM3 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHAMP1Q96JM3 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHAMP1Q96JM3 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHAMP1Q96JM3 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHAMP1Q96JM3 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHAMP1Q96JM3 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CHAMP1Q96JM3 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHAMP1Q96JM3 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CHAMP1Q96JM3 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHAMP1Q96JM3 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHAMP1Q96JM3 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHAMP1Q96JM3 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHAMP1Q96JM3 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CHAMP1Q96JM3 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CHAMP1Q96JM3 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHAMP1Q96JM3 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHAMP1Q96JM3 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHAMP1Q96JM3 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHAMP1Q96JM3 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHAMP1Q96JM3 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHAMP1Q96JM3 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHAMP1Q96JM3 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHAMP1Q96JM3 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHAMP1Q96JM3 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHAMP1Q96JM3 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHAMP1Q96JM3 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHAMP1Q96JM3 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHAMP1Q96JM3 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHAMP1Q96JM3 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHAMP1Q96JM3 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHAMP1Q96JM3 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CHAMP1Q96JM3 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHAMP1Q96JM3 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHAMP1Q96JM3 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHAMP1Q96JM3 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHAMP1Q96JM3 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHAMP1Q96JM3 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHAMP1Q96JM3 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHAMP1Q96JM3 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHAMP1Q96JM3 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHAMP1Q96JM3 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHAMP1Q96JM3 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHAMP1Q96JM3 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CHAMP1Q96JM3 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHAMP1Q96JM3 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHAMP1Q96JM3 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CHAMP1Q96JM3 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHAMP1Q96JM3 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHAMP1Q96JM3 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHAMP1Q96JM3 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHAMP1Q96JM3 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHAMP1Q96JM3 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHAMP1Q96JM3 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHAMP1Q96JM3 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHAMP1Q96JM3 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHAMP1Q96JM3 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHAMP1Q96JM3 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHAMP1Q96JM3 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHAMP1Q96JM3 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CHAMP1Q96JM3 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHAMP1Q96JM3 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHAMP1Q96JM3 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHAMP1Q96JM3 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHAMP1Q96JM3 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHAMP1Q96JM3 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHAMP1Q96JM3 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHAMP1Q96JM3 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHAMP1Q96JM3 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHAMP1Q96JM3 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHAMP1Q96JM3 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CHAMP1Q96JM3 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CHAMP1Q96JM3 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHAMP1Q96JM3 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHAMP1Q96JM3 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CHAMP1Q96JM3 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHAMP1Q96JM3 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHAMP1Q96JM3 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHAMP1Q96JM3 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHAMP1Q96JM3 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHAMP1Q96JM3 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHAMP1Q96JM3 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHAMP1Q96JM3 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHAMP1Q96JM3 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHAMP1Q96JM3 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHAMP1Q96JM3 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHAMP1Q96JM3 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHAMP1Q96JM3 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHAMP1Q96JM3 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHAMP1Q96JM3 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHAMP1Q96JM3 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHAMP1Q96JM3 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHAMP1Q96JM3 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHAMP1Q96JM3 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms