Protein–RNA interactions for Protein: Q96DM3

C18orf8, Uncharacterized protein C18orf8, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C18orf8Q96DM3 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
C18orf8Q96DM3 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
C18orf8Q96DM3 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
C18orf8Q96DM3 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
C18orf8Q96DM3 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C18orf8Q96DM3 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
C18orf8Q96DM3 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C18orf8Q96DM3 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C18orf8Q96DM3 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
C18orf8Q96DM3 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C18orf8Q96DM3 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C18orf8Q96DM3 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C18orf8Q96DM3 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C18orf8Q96DM3 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C18orf8Q96DM3 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C18orf8Q96DM3 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
C18orf8Q96DM3 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
C18orf8Q96DM3 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C18orf8Q96DM3 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
C18orf8Q96DM3 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
C18orf8Q96DM3 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C18orf8Q96DM3 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C18orf8Q96DM3 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C18orf8Q96DM3 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C18orf8Q96DM3 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C18orf8Q96DM3 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C18orf8Q96DM3 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
C18orf8Q96DM3 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
C18orf8Q96DM3 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
C18orf8Q96DM3 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
C18orf8Q96DM3 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
C18orf8Q96DM3 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C18orf8Q96DM3 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
C18orf8Q96DM3 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
C18orf8Q96DM3 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
C18orf8Q96DM3 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
C18orf8Q96DM3 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
C18orf8Q96DM3 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
C18orf8Q96DM3 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
C18orf8Q96DM3 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
C18orf8Q96DM3 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
C18orf8Q96DM3 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C18orf8Q96DM3 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
C18orf8Q96DM3 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C18orf8Q96DM3 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
C18orf8Q96DM3 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
C18orf8Q96DM3 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C18orf8Q96DM3 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C18orf8Q96DM3 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C18orf8Q96DM3 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
C18orf8Q96DM3 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C18orf8Q96DM3 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C18orf8Q96DM3 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
C18orf8Q96DM3 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C18orf8Q96DM3 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C18orf8Q96DM3 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
C18orf8Q96DM3 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C18orf8Q96DM3 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C18orf8Q96DM3 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C18orf8Q96DM3 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C18orf8Q96DM3 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
C18orf8Q96DM3 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C18orf8Q96DM3 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C18orf8Q96DM3 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
C18orf8Q96DM3 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C18orf8Q96DM3 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C18orf8Q96DM3 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
C18orf8Q96DM3 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
C18orf8Q96DM3 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
C18orf8Q96DM3 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
C18orf8Q96DM3 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
C18orf8Q96DM3 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C18orf8Q96DM3 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C18orf8Q96DM3 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C18orf8Q96DM3 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
C18orf8Q96DM3 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
C18orf8Q96DM3 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
C18orf8Q96DM3 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
C18orf8Q96DM3 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C18orf8Q96DM3 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C18orf8Q96DM3 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C18orf8Q96DM3 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C18orf8Q96DM3 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C18orf8Q96DM3 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
C18orf8Q96DM3 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C18orf8Q96DM3 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
C18orf8Q96DM3 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
C18orf8Q96DM3 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
C18orf8Q96DM3 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
C18orf8Q96DM3 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
C18orf8Q96DM3 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
C18orf8Q96DM3 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
C18orf8Q96DM3 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
C18orf8Q96DM3 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
C18orf8Q96DM3 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
C18orf8Q96DM3 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
C18orf8Q96DM3 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
C18orf8Q96DM3 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
C18orf8Q96DM3 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
C18orf8Q96DM3 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms