Protein–RNA interactions for Protein: Q96CG8

CTHRC1, Collagen triple helix repeat-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTHRC1Q96CG8 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTHRC1Q96CG8 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTHRC1Q96CG8 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTHRC1Q96CG8 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTHRC1Q96CG8 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTHRC1Q96CG8 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTHRC1Q96CG8 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTHRC1Q96CG8 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTHRC1Q96CG8 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTHRC1Q96CG8 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTHRC1Q96CG8 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTHRC1Q96CG8 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTHRC1Q96CG8 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTHRC1Q96CG8 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTHRC1Q96CG8 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTHRC1Q96CG8 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTHRC1Q96CG8 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTHRC1Q96CG8 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTHRC1Q96CG8 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CTHRC1Q96CG8 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTHRC1Q96CG8 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTHRC1Q96CG8 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CTHRC1Q96CG8 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTHRC1Q96CG8 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CTHRC1Q96CG8 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTHRC1Q96CG8 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTHRC1Q96CG8 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTHRC1Q96CG8 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CTHRC1Q96CG8 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTHRC1Q96CG8 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CTHRC1Q96CG8 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTHRC1Q96CG8 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTHRC1Q96CG8 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CTHRC1Q96CG8 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CTHRC1Q96CG8 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CTHRC1Q96CG8 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CTHRC1Q96CG8 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CTHRC1Q96CG8 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CTHRC1Q96CG8 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CTHRC1Q96CG8 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CTHRC1Q96CG8 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CTHRC1Q96CG8 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CTHRC1Q96CG8 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CTHRC1Q96CG8 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CTHRC1Q96CG8 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CTHRC1Q96CG8 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CTHRC1Q96CG8 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CTHRC1Q96CG8 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTHRC1Q96CG8 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTHRC1Q96CG8 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTHRC1Q96CG8 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTHRC1Q96CG8 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTHRC1Q96CG8 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTHRC1Q96CG8 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTHRC1Q96CG8 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTHRC1Q96CG8 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTHRC1Q96CG8 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTHRC1Q96CG8 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTHRC1Q96CG8 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTHRC1Q96CG8 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTHRC1Q96CG8 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTHRC1Q96CG8 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTHRC1Q96CG8 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTHRC1Q96CG8 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTHRC1Q96CG8 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTHRC1Q96CG8 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTHRC1Q96CG8 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTHRC1Q96CG8 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTHRC1Q96CG8 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTHRC1Q96CG8 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CTHRC1Q96CG8 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTHRC1Q96CG8 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTHRC1Q96CG8 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CTHRC1Q96CG8 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTHRC1Q96CG8 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTHRC1Q96CG8 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTHRC1Q96CG8 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTHRC1Q96CG8 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTHRC1Q96CG8 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CTHRC1Q96CG8 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTHRC1Q96CG8 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTHRC1Q96CG8 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTHRC1Q96CG8 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTHRC1Q96CG8 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTHRC1Q96CG8 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CTHRC1Q96CG8 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTHRC1Q96CG8 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTHRC1Q96CG8 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTHRC1Q96CG8 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTHRC1Q96CG8 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CTHRC1Q96CG8 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTHRC1Q96CG8 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTHRC1Q96CG8 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CTHRC1Q96CG8 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTHRC1Q96CG8 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTHRC1Q96CG8 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTHRC1Q96CG8 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CTHRC1Q96CG8 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTHRC1Q96CG8 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTHRC1Q96CG8 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms