Protein–RNA interactions for Protein: Q969K7

TMEM54, Transmembrane protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM54Q969K7 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM54Q969K7 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM54Q969K7 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM54Q969K7 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM54Q969K7 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM54Q969K7 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM54Q969K7 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM54Q969K7 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM54Q969K7 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM54Q969K7 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM54Q969K7 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM54Q969K7 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM54Q969K7 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM54Q969K7 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM54Q969K7 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM54Q969K7 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM54Q969K7 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM54Q969K7 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM54Q969K7 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM54Q969K7 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM54Q969K7 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM54Q969K7 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM54Q969K7 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM54Q969K7 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM54Q969K7 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM54Q969K7 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM54Q969K7 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM54Q969K7 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM54Q969K7 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM54Q969K7 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM54Q969K7 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM54Q969K7 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM54Q969K7 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM54Q969K7 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM54Q969K7 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM54Q969K7 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM54Q969K7 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM54Q969K7 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM54Q969K7 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM54Q969K7 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM54Q969K7 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM54Q969K7 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM54Q969K7 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM54Q969K7 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM54Q969K7 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM54Q969K7 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM54Q969K7 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM54Q969K7 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM54Q969K7 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM54Q969K7 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM54Q969K7 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM54Q969K7 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM54Q969K7 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM54Q969K7 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM54Q969K7 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM54Q969K7 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM54Q969K7 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM54Q969K7 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM54Q969K7 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM54Q969K7 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM54Q969K7 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM54Q969K7 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM54Q969K7 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM54Q969K7 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM54Q969K7 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM54Q969K7 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM54Q969K7 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM54Q969K7 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM54Q969K7 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM54Q969K7 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM54Q969K7 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM54Q969K7 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM54Q969K7 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM54Q969K7 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM54Q969K7 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM54Q969K7 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM54Q969K7 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM54Q969K7 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM54Q969K7 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM54Q969K7 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM54Q969K7 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM54Q969K7 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM54Q969K7 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM54Q969K7 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM54Q969K7 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM54Q969K7 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM54Q969K7 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM54Q969K7 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM54Q969K7 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM54Q969K7 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM54Q969K7 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM54Q969K7 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM54Q969K7 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM54Q969K7 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM54Q969K7 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM54Q969K7 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM54Q969K7 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM54Q969K7 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM54Q969K7 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM54Q969K7 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms