Protein–RNA interactions for Protein: Q969G3

SMARCE1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1Q969G3 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SMARCE1Q969G3 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SMARCE1Q969G3 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SMARCE1Q969G3 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
SMARCE1Q969G3 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SMARCE1Q969G3 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SMARCE1Q969G3 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
SMARCE1Q969G3 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SMARCE1Q969G3 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SMARCE1Q969G3 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SMARCE1Q969G3 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
SMARCE1Q969G3 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SMARCE1Q969G3 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SMARCE1Q969G3 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SMARCE1Q969G3 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SMARCE1Q969G3 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SMARCE1Q969G3 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SMARCE1Q969G3 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SMARCE1Q969G3 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SMARCE1Q969G3 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SMARCE1Q969G3 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SMARCE1Q969G3 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SMARCE1Q969G3 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SMARCE1Q969G3 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SMARCE1Q969G3 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SMARCE1Q969G3 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SMARCE1Q969G3 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
SMARCE1Q969G3 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SMARCE1Q969G3 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
SMARCE1Q969G3 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SMARCE1Q969G3 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SMARCE1Q969G3 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SMARCE1Q969G3 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SMARCE1Q969G3 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SMARCE1Q969G3 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SMARCE1Q969G3 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SMARCE1Q969G3 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SMARCE1Q969G3 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SMARCE1Q969G3 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SMARCE1Q969G3 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SMARCE1Q969G3 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SMARCE1Q969G3 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SMARCE1Q969G3 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SMARCE1Q969G3 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SMARCE1Q969G3 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SMARCE1Q969G3 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SMARCE1Q969G3 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SMARCE1Q969G3 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SMARCE1Q969G3 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SMARCE1Q969G3 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SMARCE1Q969G3 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SMARCE1Q969G3 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
SMARCE1Q969G3 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SMARCE1Q969G3 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SMARCE1Q969G3 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SMARCE1Q969G3 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SMARCE1Q969G3 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SMARCE1Q969G3 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SMARCE1Q969G3 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SMARCE1Q969G3 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SMARCE1Q969G3 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SMARCE1Q969G3 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SMARCE1Q969G3 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SMARCE1Q969G3 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SMARCE1Q969G3 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SMARCE1Q969G3 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SMARCE1Q969G3 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
SMARCE1Q969G3 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SMARCE1Q969G3 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
SMARCE1Q969G3 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SMARCE1Q969G3 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SMARCE1Q969G3 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SMARCE1Q969G3 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SMARCE1Q969G3 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SMARCE1Q969G3 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SMARCE1Q969G3 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SMARCE1Q969G3 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
SMARCE1Q969G3 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SMARCE1Q969G3 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SMARCE1Q969G3 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SMARCE1Q969G3 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SMARCE1Q969G3 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SMARCE1Q969G3 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SMARCE1Q969G3 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SMARCE1Q969G3 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SMARCE1Q969G3 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SMARCE1Q969G3 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SMARCE1Q969G3 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SMARCE1Q969G3 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SMARCE1Q969G3 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SMARCE1Q969G3 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SMARCE1Q969G3 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SMARCE1Q969G3 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SMARCE1Q969G3 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SMARCE1Q969G3 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SMARCE1Q969G3 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SMARCE1Q969G3 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SMARCE1Q969G3 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SMARCE1Q969G3 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SMARCE1Q969G3 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms