Protein–RNA interactions for Protein: Q92826

HOXB13, Homeobox protein Hox-B13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB13Q92826 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXB13Q92826 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXB13Q92826 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXB13Q92826 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXB13Q92826 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXB13Q92826 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXB13Q92826 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXB13Q92826 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXB13Q92826 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXB13Q92826 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXB13Q92826 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXB13Q92826 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXB13Q92826 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXB13Q92826 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXB13Q92826 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXB13Q92826 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXB13Q92826 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXB13Q92826 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXB13Q92826 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXB13Q92826 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXB13Q92826 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXB13Q92826 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXB13Q92826 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXB13Q92826 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXB13Q92826 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXB13Q92826 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXB13Q92826 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXB13Q92826 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXB13Q92826 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXB13Q92826 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXB13Q92826 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXB13Q92826 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXB13Q92826 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXB13Q92826 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXB13Q92826 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXB13Q92826 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXB13Q92826 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXB13Q92826 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXB13Q92826 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXB13Q92826 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXB13Q92826 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXB13Q92826 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXB13Q92826 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXB13Q92826 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXB13Q92826 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXB13Q92826 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXB13Q92826 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXB13Q92826 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXB13Q92826 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXB13Q92826 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXB13Q92826 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXB13Q92826 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXB13Q92826 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXB13Q92826 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXB13Q92826 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXB13Q92826 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXB13Q92826 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXB13Q92826 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXB13Q92826 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXB13Q92826 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXB13Q92826 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXB13Q92826 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXB13Q92826 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXB13Q92826 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXB13Q92826 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXB13Q92826 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXB13Q92826 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXB13Q92826 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXB13Q92826 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXB13Q92826 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXB13Q92826 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXB13Q92826 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXB13Q92826 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXB13Q92826 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXB13Q92826 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXB13Q92826 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXB13Q92826 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXB13Q92826 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXB13Q92826 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXB13Q92826 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXB13Q92826 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXB13Q92826 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXB13Q92826 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXB13Q92826 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXB13Q92826 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXB13Q92826 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXB13Q92826 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXB13Q92826 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXB13Q92826 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXB13Q92826 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXB13Q92826 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXB13Q92826 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXB13Q92826 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXB13Q92826 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXB13Q92826 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXB13Q92826 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXB13Q92826 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXB13Q92826 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXB13Q92826 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXB13Q92826 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms