Protein–RNA interactions for Protein: Q92696

RABGGTA, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 567 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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RABGGTAQ92696 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
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RABGGTAQ92696 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
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RABGGTAQ92696 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
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