Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDD5

MCOLN3, Mucolipin-3, humanhuman

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCOLN3Q8TDD5 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MCOLN3Q8TDD5 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MCOLN3Q8TDD5 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MCOLN3Q8TDD5 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
MCOLN3Q8TDD5 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
MCOLN3Q8TDD5 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
MCOLN3Q8TDD5 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
MCOLN3Q8TDD5 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MCOLN3Q8TDD5 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
MCOLN3Q8TDD5 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
MCOLN3Q8TDD5 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MCOLN3Q8TDD5 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MCOLN3Q8TDD5 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
MCOLN3Q8TDD5 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MCOLN3Q8TDD5 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
MCOLN3Q8TDD5 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MCOLN3Q8TDD5 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MCOLN3Q8TDD5 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
MCOLN3Q8TDD5 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MCOLN3Q8TDD5 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MCOLN3Q8TDD5 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MCOLN3Q8TDD5 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
MCOLN3Q8TDD5 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
MCOLN3Q8TDD5 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MCOLN3Q8TDD5 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MCOLN3Q8TDD5 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MCOLN3Q8TDD5 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
MCOLN3Q8TDD5 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MCOLN3Q8TDD5 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
MCOLN3Q8TDD5 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MCOLN3Q8TDD5 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
MCOLN3Q8TDD5 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MCOLN3Q8TDD5 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MCOLN3Q8TDD5 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MCOLN3Q8TDD5 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
MCOLN3Q8TDD5 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MCOLN3Q8TDD5 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
MCOLN3Q8TDD5 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
MCOLN3Q8TDD5 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
MCOLN3Q8TDD5 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
MCOLN3Q8TDD5 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
MCOLN3Q8TDD5 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
MCOLN3Q8TDD5 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
MCOLN3Q8TDD5 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
MCOLN3Q8TDD5 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MCOLN3Q8TDD5 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
MCOLN3Q8TDD5 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
MCOLN3Q8TDD5 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
MCOLN3Q8TDD5 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MCOLN3Q8TDD5 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MCOLN3Q8TDD5 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
MCOLN3Q8TDD5 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MCOLN3Q8TDD5 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MCOLN3Q8TDD5 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
MCOLN3Q8TDD5 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
MCOLN3Q8TDD5 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MCOLN3Q8TDD5 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MCOLN3Q8TDD5 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MCOLN3Q8TDD5 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MCOLN3Q8TDD5 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
MCOLN3Q8TDD5 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MCOLN3Q8TDD5 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MCOLN3Q8TDD5 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MCOLN3Q8TDD5 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
MCOLN3Q8TDD5 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
MCOLN3Q8TDD5 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
MCOLN3Q8TDD5 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MCOLN3Q8TDD5 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
MCOLN3Q8TDD5 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MCOLN3Q8TDD5 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MCOLN3Q8TDD5 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
MCOLN3Q8TDD5 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MCOLN3Q8TDD5 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MCOLN3Q8TDD5 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MCOLN3Q8TDD5 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MCOLN3Q8TDD5 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MCOLN3Q8TDD5 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MCOLN3Q8TDD5 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MCOLN3Q8TDD5 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MCOLN3Q8TDD5 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MCOLN3Q8TDD5 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
MCOLN3Q8TDD5 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
MCOLN3Q8TDD5 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
MCOLN3Q8TDD5 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MCOLN3Q8TDD5 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
MCOLN3Q8TDD5 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
MCOLN3Q8TDD5 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
MCOLN3Q8TDD5 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
MCOLN3Q8TDD5 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
MCOLN3Q8TDD5 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
MCOLN3Q8TDD5 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MCOLN3Q8TDD5 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
MCOLN3Q8TDD5 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
MCOLN3Q8TDD5 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
MCOLN3Q8TDD5 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
MCOLN3Q8TDD5 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
MCOLN3Q8TDD5 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
MCOLN3Q8TDD5 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
MCOLN3Q8TDD5 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
MCOLN3Q8TDD5 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms